| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,454,808 | C→T | 7.3% | G268S (GGC→AGC) | fbp ← | fructose‑1,6‑bisphosphatase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,454,808 | 0 | C | T | 7.3% | 291.5 / 8.2 | 95 | G268S (GGC→AGC) | fbp | fructose‑1,6‑bisphosphatase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/48); new base T (2/5); total (42/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTACTTCT > NC_000913/4454660‑4454957 | tGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCg > 1:367535/1‑150 (MQ=255) gTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACGGCAAACTGCGTTTGCTGta < 1:357182/150‑2 (MQ=255) gTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTc > 1:1624117/1‑150 (MQ=255) tCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTcc < 2:297947/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACGGCAAACTGCGTTTGCTGtatg < 1:337243/150‑4 (MQ=255) gTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCgg < 2:761099/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCgg < 1:1259191/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACTGCGTTTGCTGtatgag < 1:753806/150‑6 (MQ=255) aCAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGtggctg < 1:1296664/150‑1 (MQ=255) aaGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACTGCGTTTGCTGt > 1:1417804/1‑136 (MQ=255) aaGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACTGCGTTTGCTGt < 2:1417804/136‑1 (MQ=255) aaGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCg < 1:985835/150‑1 (MQ=255) aaGAATGAACGGCCCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCGAGAATACGCTCTATGACATCGCTCGCTTTACCGACCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGGAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCg > 2:808932/1‑150 (MQ=255) aGAATGAACGTCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTATTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCgg < 2:1476891/150‑1 (MQ=255) aGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCgg > 1:305778/1‑150 (MQ=255) aGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCgg < 1:1222566/150‑1 (MQ=255) aGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCgg < 1:1659218/150‑1 (MQ=255) gAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCGCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGt < 1:1572255/150‑1 (MQ=255) tGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCt < 2:830445/150‑1 (MQ=255) aaCGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTg > 1:939584/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATAGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTg > 1:1127871/1‑150 (MQ=255) cGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTggg < 1:860987/150‑1 (MQ=255) ggggcTGGTGCATGGTTTCCGGGTTGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGt < 2:110364/147‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCATAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGt < 2:105133/150‑1 (MQ=255) gcTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTaga < 2:1395187/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTagag < 1:1536815/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTagag > 2:1063196/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATaa > 1:679469/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATaaa > 1:826136/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCCTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATaaa > 1:1187425/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAAt < 1:212792/150‑1 (MQ=255) gTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATAccc > 2:295786/1‑149 (MQ=255) gTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCg < 1:1264910/150‑1 (MQ=255) 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ttccgctctTACAGCAATCGGAGTTTGCCGTCCGGGTGGCGGGCGGGGCTTGGGTTGTGATAAATACCGCCTTTCAGCTGTTTTTGGTGGTATTCCGCGAGCAGTGAACGGTTATTACGTGTGGTATAAGGGCGGTTTGTGGATTTAtgt < 2:1258906/145‑3 (MQ=255) tGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtctt < 2:367535/150‑1 (MQ=255) gCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtcttc < 2:82213/150‑1 (MQ=255) gCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtcttc > 1:866221/1‑150 (MQ=255) cACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtcttct > 2:1429217/1‑150 (MQ=255) cATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTg > 2:994305/1‑114 (MQ=255) cATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTg < 1:994305/114‑1 (MQ=255) aTACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTg < 1:1665831/150‑1 (MQ=255) aGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAg < 1:1074158/150‑1 (MQ=255) aaCGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAAtt > 1:1284495/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAAttt > 1:1076163/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTaa > 1:344241/1‑150 (MQ=255) gTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGt > 1:1098568/1‑150 (MQ=255) gTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGt < 2:1304086/150‑1 (MQ=255) tttGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTa < 2:826136/150‑1 (MQ=255) cGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTActtct < 2:939584/150‑1 (MQ=255) | TGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTACTTCT > NC_000913/4454660‑4454957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |