Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 858,421 | A→T | 8.0% | L214H (CTT→CAT) ‡ | ybiU ← | DUF1479 domain‑containing protein YbiU |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 858,421 | 0 | A | T | 8.0% | 346.5 / 15.5 | 112 | L214H (CTT→CAT) ‡ | ybiU | DUF1479 domain‑containing protein YbiU |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/60); new base T (5/4); total (48/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.68e-01 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCCAGCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCCACAG > NC_000913/858272‑858569 | gCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAagcag < 2:1532916/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAagcag > 1:543535/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAagcag < 1:1326593/150‑1 (MQ=255) cccTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCTTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCGATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAtgcagc < 2:1486949/150‑1 (MQ=255) cccTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAagcagc > 2:1244252/1‑150 (MQ=255) ccTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGcagcc < 1:505101/150‑1 (MQ=255) tGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGcagccag < 1:226171/150‑1 (MQ=255) tGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGcagccag < 2:292396/150‑1 (MQ=255) 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ggtgggGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATg < 1:734903/150‑1 (MQ=255) gtggtgTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATgc > 2:410070/1‑150 (MQ=255) tggtgTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATgcg < 2:562090/150‑1 (MQ=255) gtgtTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCTCATGCCAGGGATCATATTGCGCCACATTGCCATTAAAGACGTTGGCTAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCt < 2:1051339/150‑1 (MQ=255) gtgtTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCt < 1:667099/150‑1 (MQ=255) 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aCGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATg > 1:1074705/1‑114 (MQ=255) aCGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATg < 2:1074705/114‑1 (MQ=255) actggaaCGCTGGCTGCTTCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACttt > 2:701518/7‑150 (MQ=255) cTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGGCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGGCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTc < 2:321982/150‑1 (MQ=255) tggaaCGCTGGCTGCTTCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCa > 1:1639345/5‑150 (MQ=255) ggaaCGCTGGCTGCTTCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCaa > 2:391041/4‑150 (MQ=255) 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cGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGt > 2:1547672/1‑150 (MQ=255) cGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGt > 1:488229/1‑150 (MQ=255) gAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCcaca < 1:1117269/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCcaca < 1:213819/150‑1 (MQ=255) aaGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCCACAg > 2:1655760/1‑150 (MQ=255) | TCCAGCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCCACAG > NC_000913/858272‑858569 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |