| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 858,424 | 0 | A | T | 8.1% | 332.7 / 13.5 | 110 | L213Q (CTG→CAG) ‡ | ybiU | DUF1479 domain‑containing protein YbiU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/57); new base T (5/4); total (49/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCCACAGACGA > NC_000913/858276‑858573 | gCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAagcag < 2:1532916/150‑1 (MQ=255)gCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAagcag < 1:1326593/150‑1 (MQ=255) cccTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCTTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCGATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAtgcagc < 2:1486949/150‑1 (MQ=255) 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GCCCTGGAATGTCCGAAACACGGAACATTTGGTGGTGTTGTCCACCGTGTACTCTTCAACTTCCGTACGATGTGCCGCATGCCAGGGATCATATTGCGCCAGATTGCCATTAAAGACGTTGGCGAAAACGCGCTGATACGCTGGAAGCAGCCAGCGTTCCAGTGCCCCGGAGTCGGTATGCGCTCCAAGACCTTTGGAGGTCGTTCCGGGCGGACGGCGGCGGATACGGTCAGGGTAGATGACGCTCACATCCGGGTTAAACCATTGCTTTCCATCACTTTCAAATGTCCACAGACGA > NC_000913/858276‑858573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |