Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,153,219 | G→A | 7.6% | intergenic (+39/‑81) | fabF → / → pabC | beta‑ketoacyl‑[acyl carrier protein] synthase II/aminodeoxychorismate lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,153,219 | 0 | G | A | 7.6% | 312.9 / 9.6 | 104 | intergenic (+39/‑81) | fabF/pabC | beta‑ketoacyl‑[acyl carrier protein] synthase II/aminodeoxychorismate lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/52); new base A (3/5); total (47/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.30e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGA > NC_000913/1153070‑1153367 | cTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCggg > 1:189305/1‑150 (MQ=255) tGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGc > 1:1094004/1‑150 (MQ=255) ggATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGcc > 2:700366/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |