| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,397,643 | C→A | 5.4% | intergenic (+21/+29) | ynaJ → / ← uspE | DUF2534 domain‑containing protein YnaJ/universal stress protein with a role cellular motility |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,397,643 | 0 | C | A | 5.4% | 435.7 / 8.1 | 127 | intergenic (+21/+29) | ynaJ/uspE | DUF2534 domain‑containing protein YnaJ/universal stress protein with a role cellular motility |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/61); new base A (2/5); total (61/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CCGCTGTCTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATGCTGCT > NC_000913/1397494‑1397792 | ccGCTGTCTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAAc > 2:372072/1‑150 (MQ=255)ccGCTGTCTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAAc > 2:1367472/1‑150 (MQ=255) gCTGTCTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTc > 2:684643/1‑150 (MQ=255) tCTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGc < 1:1537510/150‑1 (MQ=255) ctcacacgaccacATCAATGTATGTCATTCAGTCATCTATGATATTTGTATATAAACTCGAATTTACTGTGATTCTCGCAATCCAGTATGTAATTAATTACCATGGCGGCGAAGAGCAGTAAGAAAAAAATAGGAACAATAACACGGGcc > 2:507905/8‑150 (MQ=255) cTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCTCGTTGGGAATTTATTTCCTTGTCGGCGTAGAGCTGTAAGTATAAAATAGGATCGATAAATgggggc < 2:685396/150‑3 (MQ=255) cTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGcc > 1:142900/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCt > 1:470043/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCt > 2:1534336/1‑150 (MQ=255) gAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCtt > 1:1400033/1‑150 (MQ=255) aGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTg > 1:441266/1‑150 (MQ=255) tGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTc < 2:118248/150‑1 (MQ=255) acgacATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGt < 1:1305547/150‑1 (MQ=255) acgacATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGAGTTATCGGGCCtatttttt < 2:1572050/150‑8 (MQ=255) acgacATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGAGTTATCGGGCCtatttttt < 2:1566265/150‑8 (MQ=255) acATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTAt > 1:737737/1‑150 (MQ=255) cATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTAtt > 1:1652162/1‑150 (MQ=255) tCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGa > 1:41928/1‑150 (MQ=255) tCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGa > 1:1663215/1‑150 (MQ=255) aaTGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAag < 1:871707/150‑1 (MQ=255) atgtatgtGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTg > 2:1392928/1‑146 (MQ=255) tgtatgtGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAagag < 1:144241/150‑1 (MQ=255) tgtatgtGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAagag < 2:1013701/150‑1 (MQ=255) atgtGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCg > 1:1301080/1‑150 (MQ=255) atgtGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCg > 1:679134/1‑150 (MQ=255) gtgCTTCAGTCCTCGATGATTTTTGCTTCTAGCCGGGGCTTTACTGTGTTGCGGGCAATCCCGGTGGGAAATTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTAATGAAGAGTCGtt < 2:1099555/150‑1 (MQ=255) gtgATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGtt > 1:1138179/1‑150 (MQ=255) tgATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTa < 2:1182422/150‑1 (MQ=255) gATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTaa > 2:912067/1‑150 (MQ=255) atgcAGTCATCGATGAGTTTTGTTTAAAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCTAAATCTCGTGCATTTTCAGTTTTTGAAGATTCTTTact < 2:1096129/147‑3 (MQ=255) aTTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAAt > 2:747089/1‑150 (MQ=255) aTTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAAt > 1:1473260/1‑150 (MQ=255) aTTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAAt > 1:1210719/1‑150 (MQ=255) tCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCg > 2:47258/1‑150 (MQ=255) aGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGtc > 2:1219340/1‑150 (MQ=255) aGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGtc > 1:930494/1‑150 (MQ=255) tCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTcttctt > 2:543393/1‑150 (MQ=255) cGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCttcttc < 1:1367472/150‑1 (MQ=255) gatgatTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCg < 1:831807/150‑1 (MQ=255) gatgatTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTCATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCg < 1:796127/150‑1 (MQ=255) atgatTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGt < 1:833958/150‑1 (MQ=255) atTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGAGTTATCGGGCCtatt < 2:140973/113‑4 (MQ=255) atTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGAGTTATCGGGCCtatt > 1:140973/1‑110 (MQ=255) atTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGAGTTATCGGGCCtatt < 2:134912/113‑4 (MQ=255) ttttGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATcc < 2:797090/150‑1 (MQ=255) gTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGtt > 1:1364202/1‑150 (MQ=255) gTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGtt < 1:912067/150‑1 (MQ=255) gTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGtt > 1:653656/1‑150 (MQ=255) taGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACg > 1:1467960/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGCGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACgg > 1:276154/1‑150 (MQ=255) gTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCt > 2:466843/1‑150 (MQ=255) cTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGa > 2:234549/1‑150 (MQ=255) tACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCATTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATAc > 2:1366890/1‑150 (MQ=255) aCTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTTGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACt < 2:288627/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTgg < 2:522574/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGt > 2:277579/1‑150 (MQ=255) tGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGttt < 1:570687/150‑1 (MQ=255) aaTCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATg < 1:29117/150‑1 (MQ=255) aaTCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATg < 1:296138/150‑1 (MQ=255) cccGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTCATGAcc < 2:233064/150‑1 (MQ=255) cccGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGAcc > 1:1283800/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACca > 1:370400/1‑150 (MQ=255) gTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACcagc > 2:578310/1‑150 (MQ=255) ttGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTGATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACcagca < 2:542797/150‑1 (MQ=255) gggAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAgg < 2:470043/150‑1 (MQ=255) ggAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTg > 1:781236/1‑121 (MQ=255) ggAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTg < 2:781236/121‑1 (MQ=255) gAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGATTTAATGACCAGCAGGTc > 1:1351030/1‑150 (MQ=255) tatttCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGc > 1:1093347/1‑150 (MQ=255) tatttCCTTGGAGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGc < 1:861016/150‑1 (MQ=255) tttCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAATTAGGCCCGATTACTCGGGCCTTGTCAGTTAGTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGGCTGTTACTGTTCAGGTTTTATGACCAGCATGTCGCAGCGa < 2:1252563/150‑1 (MQ=255) tttCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGa > 1:1585106/1‑150 (MQ=255) tttCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGCGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGa > 2:1188079/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGaa > 1:651683/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAga < 1:372072/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAgatg > 1:1032508/1‑150 (MQ=255) ttGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCCTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAgatg > 2:863204/1‑150 (MQ=255) ggcggcGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAgatgat < 2:651683/150‑1 (MQ=255) ggcggcGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAgatgat < 1:747089/150‑1 (MQ=255) ggcggcGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAgatgat < 2:1301080/150‑1 (MQ=255) gcggcgAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGatc < 2:574010/150‑1 (MQ=255) gcggcgAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGatc < 2:1410949/150‑1 (MQ=255) gcggcgAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGatc < 1:47258/150‑1 (MQ=255) gcggcgAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGatc < 2:142900/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGatcaatca < 2:441266/150‑1 (MQ=255) gagCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCt < 2:1579298/150‑1 (MQ=255) agCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTg < 2:1210719/150‑1 (MQ=255) gCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGt > 1:1201627/1‑150 (MQ=255) agtaagtaAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTc > 2:1347030/1‑150 (MQ=255) aagtaaAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTccgc < 2:1093347/150‑1 (MQ=255) gtaaAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTccgccg < 2:1609060/150‑1 (MQ=255) gtaaAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTccgccg < 2:695767/150‑1 (MQ=255) gtaaAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTccgccg > 2:391435/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCgtgt < 1:1219340/150‑1 (MQ=255) aaaTAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTg < 2:1277727/150‑1 (MQ=255) aaaTAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTg > 1:718915/1‑150 (MQ=255) ggCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAg > 1:695472/1‑150 (MQ=255) ggCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAg > 2:898829/1‑150 (MQ=255) cccGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGa < 1:1127710/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATgctgct > 2:292126/1‑150 (MQ=255) | CCGCTGTCTGAGTGGACGACATCAATGTATGTGATTCAGTCATCGATGATTTTTGTTTATAGCCTGGTCTTTACTGTGTTGCTGGCAATCCCGTTGGGAATTTATTTCCTTGGCGGCGAAGAGCAGTAAGTAAAAAATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAGCAGGTCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATGCTGCT > NC_000913/1397494‑1397792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |