| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 256,915 | C→T | 5.4% | T130M (ACG→ATG) | frsA → | fermentation‑respiration switch protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 256,915 | 0 | C | T | 5.4% | 355.3 / 6.2 | 110 | T130M (ACG→ATG) | frsA | fermentation‑respiration switch protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/44); new base T (2/4); total (62/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TACCGACGATGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCCGGCGGTGCG > NC_000913/256766‑257063 | tACCGACGATGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTAc > 2:1154975/1‑150 (MQ=255) ccGACGATGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGt < 1:1529885/150‑1 (MQ=255) cgacgaTGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGtt < 2:16834/150‑1 (MQ=255) gacgaTGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTg < 2:1468389/150‑1 (MQ=255) cgaTGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTa < 2:1451767/150‑1 (MQ=255) gatgatTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTac > 1:591932/1‑150 (MQ=255) gatgatTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTac > 1:1488765/1‑150 (MQ=255) ttATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACAtt > 2:491470/1‑150 (MQ=255) atacgatacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTgc > 1:622642/1‑150 (MQ=255) atacgatacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTgc > 1:361968/1‑150 (MQ=255) gatacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAAGTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTgccgcc < 2:511746/150‑1 (MQ=255) gatacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTgccgcc < 2:1530558/150‑1 (MQ=255) atacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAATAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTGGTCACTGGCTGCATGCGGCAATGTTGTACAACGTAgccgcat < 2:69806/150‑3 (MQ=255) atacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCAATGTTGTACAACGTAgccgcat < 1:1065869/150‑3 (MQ=255) tacgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAATGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCTGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGGTACGTTGTACAACATTGCCGCCTa < 2:1451961/150‑1 (MQ=255) acgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCAATGTTGTACAACGTAgccgcatgc < 1:20488/150‑5 (MQ=255) acgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCAATGTTGTACAACGTAgccgcatgc < 2:1082637/150‑5 (MQ=255) cgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATc > 1:1367578/1‑150 (MQ=255) cgGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATc < 2:1629431/150‑1 (MQ=255) tGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCACCTCAGGGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCtg > 2:312748/1‑149 (MQ=255) tGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTc > 2:1531358/1‑150 (MQ=255) aTTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCAt > 1:1292241/1‑150 (MQ=255) ggCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTg > 1:803799/1‑150 (MQ=255) ggCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTg > 2:1668266/1‑150 (MQ=255) ggCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACACAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTg > 2:1225912/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAgg > 1:858592/1‑150 (MQ=255) ggcggcAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTGACTGGCTGCATTCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCGTATCCTCATCTGATAGGAGAt < 2:825432/150‑1 (MQ=255) gcggcAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATg > 2:420878/1‑150 (MQ=255) gcAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGAcc > 2:189833/1‑150 (MQ=255) cAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCt > 1:34950/1‑150 (MQ=255) aCTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTgg > 1:533548/1‑150 (MQ=255) cTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGc < 1:914526/150‑1 (MQ=255) cTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGc > 1:800287/1‑150 (MQ=255) cTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGc < 1:835156/150‑1 (MQ=255) gATTTATGAGTGGGCCACGCAGGCGATGGTGCGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATGCGCAACTCAGTGTTCGTCACTGGCTGGATGCGGCTACGTTGTTCAACATTGACGCCTATCCTGATCTGAAAGGAGATGACATGGCCGa < 2:856444/150‑1 (MQ=255) gATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGa > 2:793390/1‑150 (MQ=255) tttATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGc > 1:174851/1‑150 (MQ=255) gAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTGCGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAgcg > 1:1142450/1‑150 (MQ=255) gTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTTGCAACAAAAAGCCTGGGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGGCGTCACTGGCTGCAGGCGGCTACGTCGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCa < 1:1567845/150‑1 (MQ=255) gTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCa > 2:276477/1‑150 (MQ=255) ggCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGc > 2:56392/1‑150 (MQ=255) ggCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGc > 1:160510/1‑150 (MQ=255) gCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCt > 2:437790/1‑150 (MQ=255) gCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCt < 2:858592/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTc < 1:1488193/150‑1 (MQ=255) cGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAAcc < 1:1225912/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCgcgc > 1:1218818/1‑150 (MQ=255) gtgtGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGcc < 2:1536617/150‑1 (MQ=255) ggCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGCCGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATg > 1:1434278/1‑150 (MQ=255) ggCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATg < 2:1596309/150‑1 (MQ=255) gCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGCTCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGa > 2:582942/1‑150 (MQ=255) gCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGa < 1:442203/150‑1 (MQ=255) aacaaAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAag < 2:693928/150‑1 (MQ=255) caaAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAg > 2:1646934/1‑118 (MQ=255) caaAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAg < 1:1646934/118‑1 (MQ=255) aaaaaGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTCCTCGTCACTGGCTGCATGCCGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCAACAGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAgg > 2:17621/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGcc < 1:96132/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGcc > 1:1528952/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGcc < 1:1531358/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCa > 1:1550379/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCGGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATGCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAg < 2:869294/150‑1 (MQ=255) gtgCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGc > 1:1067413/1‑150 (MQ=255) tgCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCg > 1:661344/1‑150 (MQ=255) cGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGACTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTc > 1:1161/1‑150 (MQ=255) ggAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCt > 2:1472102/1‑150 (MQ=255) ggAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCt > 2:1662587/1‑150 (MQ=255) gAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTa > 1:1530444/1‑150 (MQ=255) aGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTAcc < 1:1471055/150‑1 (MQ=255) gATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGc > 1:351095/1‑150 (MQ=255) gATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGc > 2:109456/1‑150 (MQ=255) gATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGc < 1:965792/150‑1 (MQ=255) ccGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACg > 1:1454981/1‑150 (MQ=255) cGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGa < 2:361968/150‑1 (MQ=255) cTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCgg < 1:1561992/150‑1 (MQ=255) tCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGACGCGGc < 2:1394224/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCa < 1:793390/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTCGTCACTGGCTGCATCCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCa < 1:1668266/150‑1 (MQ=255) ggTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATg < 1:189833/150‑1 (MQ=255) ggTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATg > 2:60354/1‑150 (MQ=255) tcgtcACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGa > 2:538211/1‑150 (MQ=255) gtcACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGt > 1:1330593/1‑150 (MQ=255) aCTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTa > 1:741544/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCTATCAAGCGCATGCTTTGTCAAACCTCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTATACCGTGCACGATGCGGCAGATTGAGTTTAc < 2:803799/150‑1 (MQ=255) ggCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCg < 2:1067413/150‑1 (MQ=255) ggCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCg > 1:392479/1‑150 (MQ=255) ggCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCg < 2:533548/150‑1 (MQ=255) gCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTAcc > 2:519860/1‑150 (MQ=255) gCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTAcc < 2:800287/150‑1 (MQ=255) gCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTAcc > 2:59541/1‑150 (MQ=255) gCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTAcc < 2:591932/150‑1 (MQ=255) gCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTAcc > 2:53467/1‑150 (MQ=255) gCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTAcc < 2:1488765/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCa > 2:580267/1‑129 (MQ=255) tGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCa < 1:580267/129‑1 (MQ=255) ggCGGCAATGTTGTACAACGTAGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCcgg > 2:128746/2‑150 (MQ=255) gCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCcggc > 2:406233/1‑150 (MQ=255) gCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCcggc < 2:1218818/150‑1 (MQ=255) gCGGCAATGTTGTACAACGTAGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCATATGGAGTTTACCGTACCcggc > 1:764109/1‑150 (MQ=255) tACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCCGGCGGTgc < 1:1154975/150‑1 (MQ=255) aCGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCCGGCGGTgcg > 2:1670930/1‑150 (MQ=255) | TACCGACGATGATTTATACGATACGGTGATTGGCTACCGTGGCGGCAACTGGATTTATGAGTGGGCCACCCAGGCGATGGTGTGGCAACAAAAAGCCTGTGCGGAAGACGATCCGCAACTCAGTGGTCGTCACTGGCTGCATGCGGCTACGTTGTACAACATTGCCGCCTATCCTCATCTGAAAGGAGATGACCTGGCCGAGCAAGCGCAGGCTTTGTCAAACCGCGCCTATGAAGAGGCCGCTCAGCGTCTACCGGGCACGATGCGGCAGATGGAGTTTACCGTACCCGGCGGTGCG > NC_000913/256766‑257063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |