| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,590,603 | G→C | 5.5% | intergenic (‑67/+251) | yneL ← / ← hipA | putative HTH‑type transcriptional regulator YneL/serine/threonine kinase HipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,590,603 | 0 | G | C | 5.5% | 373.6 / 8.6 | 109 | intergenic (‑67/+251) | yneL/hipA | putative HTH‑type transcriptional regulator YneL/serine/threonine kinase HipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/53); new base C (3/3); total (53/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GTGGTGACATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGAT > NC_000913/1590454‑1590751 | gtggtgACATCTTATTGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGTCTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACAGGAGTGGAATCATTCCCTCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAAGAGCACACTCACGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCg < 1:970295/150‑1 (MQ=255) tggtgACATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCga > 1:930358/1‑150 (MQ=255) ggtgACATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgac < 2:80856/150‑1 (MQ=255) aCATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgacagac < 1:846913/150‑1 (MQ=255) cATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgacagaca < 2:494610/150‑1 (MQ=255) cATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgacagaca > 1:350593/1‑150 (MQ=255) cATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgacagaca > 2:67822/1‑150 (MQ=255) aTCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGacac < 2:1192852/150‑1 (MQ=255) cGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTg < 1:376711/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTGTCGCATAGACACTgcat < 1:701471/150‑3 (MQ=255) aaTGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTgcgc < 2:1228722/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTgcgc < 2:596909/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTgcgc < 1:1289843/150‑1 (MQ=255) aTGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTGTCGCATAGACACTgcata < 1:344039/150‑4 (MQ=255) tGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTGTCGCATAGACACTgcatac < 1:151401/150‑5 (MQ=255) ttcattcaGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCtt < 1:544024/150‑1 (MQ=255) ttcattcaGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCtt < 2:232433/150‑1 (MQ=255) cattcaGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAg > 1:136544/1‑150 (MQ=255) cattcaGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAg < 2:278405/150‑1 (MQ=255) attcaGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGc > 1:1485006/1‑150 (MQ=255) aGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATgg < 1:673520/150‑1 (MQ=255) gCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATggg < 2:1196012/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAgg < 2:279828/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAgg > 1:1602673/1‑150 (MQ=255) gTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAggg < 2:1210697/150‑1 (MQ=255) gTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAggg < 2:1602052/150‑1 (MQ=255) ttCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAgg < 2:1374199/150‑1 (MQ=255) ttCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAgg > 2:1605742/1‑150 (MQ=255) ttGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTAt > 1:1062581/1‑150 (MQ=255) ttGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTAt > 1:1240610/1‑150 (MQ=255) ttGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTAt > 2:1535498/1‑150 (MQ=255) tGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAggg > 2:1018316/1‑135 (MQ=255) tGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAggg < 1:1018316/135‑1 (MQ=255) tGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTAtt > 2:260149/1‑150 (MQ=255) tGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTAtt > 2:279455/1‑150 (MQ=255) cGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTcc < 2:1520574/150‑1 (MQ=255) gTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCa < 2:685802/150‑1 (MQ=255) tAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCAt > 2:124522/1‑150 (MQ=255) aGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCGGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTATTAGCATGGGGCAGGGAATAAACAGGCTATTTCTCCATg > 2:596884/1‑150 (MQ=255) cATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGcac > 1:880080/1‑150 (MQ=255) ttCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAgg < 1:279455/150‑1 (MQ=255) ttCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAgg < 1:1632515/150‑1 (MQ=255) cTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGcc < 2:464013/150‑1 (MQ=255) tACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAAtt > 1:962971/1‑150 (MQ=255) ccGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTTTGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAAGCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTAt < 1:228737/150‑1 (MQ=255) gAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGaa < 1:1168616/150‑1 (MQ=255) ggACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCTCTCTTAGCATTGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAagag < 1:1524872/150‑1 (MQ=255) ggACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAagag > 2:615762/1‑150 (MQ=255) aCTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGAAACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCAATGCACAGGCCAATTATGAAagagga > 1:1436324/1‑150 (MQ=255) cTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAagaggag > 2:1373544/1‑150 (MQ=255) cATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAagaggagag > 2:1574327/1‑150 (MQ=255) cATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAagaggagag > 2:1671463/1‑150 (MQ=255) cATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAagaggagag < 1:260149/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCt < 2:1154057/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTa < 2:268531/150‑1 (MQ=255) gCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAg < 1:448359/150‑1 (MQ=255) tGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTc > 2:1628859/1‑150 (MQ=255) tCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAAtt < 2:829018/123‑1 (MQ=255) tCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAAtt > 1:829018/1‑123 (MQ=255) tCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTg < 2:1511561/150‑1 (MQ=255) tCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTg < 2:350593/150‑1 (MQ=255) ccTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAAccc > 2:707242/1‑150 (MQ=255) ccTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAAccc > 1:1188027/1‑150 (MQ=255) cTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCt > 1:924450/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAAc > 2:1396314/1‑150 (MQ=255) aTAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACg > 2:1442570/1‑150 (MQ=255) aTAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACg > 1:1473858/1‑150 (MQ=255) tAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGa > 1:1015612/1‑150 (MQ=255) tAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGa > 2:1086078/1‑150 (MQ=255) tAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACAGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCAATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAAcca > 2:25384/1‑148 (MQ=255) gTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATa < 1:86287/150‑1 (MQ=255) aaCAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAAc < 2:962971/150‑1 (MQ=255) gCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACt > 2:586921/1‑150 (MQ=255) gCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACt > 1:1014137/1‑150 (MQ=255) gCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACt > 1:1646603/1‑150 (MQ=255) gCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACt > 2:545061/1‑150 (MQ=255) cccTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTAcc < 1:1442570/150‑1 (MQ=255) cccTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTAcc > 2:238407/1‑150 (MQ=255) cccTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCCCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTAcc < 1:1153043/150‑1 (MQ=255) ctctGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAg < 2:1071375/150‑1 (MQ=255) ctctGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAg < 1:67822/150‑1 (MQ=255) tctGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGa > 1:452708/1‑150 (MQ=255) ggTGTTTTGGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGGGCGCTTAGCATGGGGCTGGCAATAACCAGGCTTTTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGTGGCTTATGTTCTTTAACCCTGAACGAATCACGACTACCAGaaaa < 2:727845/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGTTGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGATAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGaaaa < 2:1291425/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGaaaa < 2:104321/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGaaaa < 2:880080/150‑1 (MQ=255) tgtTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGc < 1:1574327/150‑1 (MQ=255) tttCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATTCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACt < 1:1104792/150‑1 (MQ=255) tttCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACt > 1:815364/1‑150 (MQ=255) agagcgCAGTGTCTGTCGCATAGACACTGCACTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCg > 1:501533/6‑150 (MQ=255) gTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGc > 1:1157615/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATc < 1:124522/150‑1 (MQ=255) tGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATc > 1:895274/1‑150 (MQ=255) cgCAGTGTCTGTCGCATAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATc > 2:470346/2‑150 (MQ=255) gCAGTGTCTGTCGCATAGCCACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATACCCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCa > 2:1027544/1‑150 (MQ=255) gCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTc < 1:328589/144‑1 (MQ=255) gCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTAAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTc > 2:328589/1‑144 (MQ=255) gtCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAg < 2:277979/150‑1 (MQ=255) tGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATg < 2:688675/150‑1 (MQ=255) cGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGAt > 2:868647/1‑150 (MQ=255) | GTGGTGACATCGTAATGTTCATTCAGCATCTGTCGCCTGACTTCATTGAGACGTAGCCATTTCTGATACCGGAGTGGACTCATTCCCGCTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGAT > NC_000913/1590454‑1590751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |