| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,709,897 | G→A | 5.3% | L252L (CTG→CTA) ‡ | rsxD → | SoxR [2Fe‑2S] reducing system protein RsxD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,709,897 | 0 | G | A | 5.3% | 239.6 / 2.2 | 75 | L252L (CTG→CTA) ‡ | rsxD | SoxR [2Fe‑2S] reducing system protein RsxD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/38); new base A (2/2); total (35/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.81e-01 | |||||||||||
ATTATGCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGGTCGTCTTA > NC_000913/1709754‑1710045 | aTTATGCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTa < 2:377670/150‑1 (MQ=255) tATGCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATg < 2:1429192/150‑1 (MQ=255) aTGCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCCAGCGTTacta < 1:1370863/150‑4 (MQ=255) tGCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATgcg < 2:843879/150‑1 (MQ=255) gCAATATCCGATCTACTGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATgcgc < 1:892161/150‑1 (MQ=255) gCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATgcgc < 2:1263458/150‑1 (MQ=255) cAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCa > 1:1097993/1‑150 (MQ=255) tatCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATg > 1:996952/1‑150 (MQ=255) atCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGt < 2:542123/150‑1 (MQ=255) ccGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTg < 1:1012252/150‑1 (MQ=255) cGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTgg > 2:1154395/1‑150 (MQ=255) aCAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGgt < 1:155516/150‑1 (MQ=255) aCAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGgt < 1:264964/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGgtt < 2:418296/149‑1 (MQ=255) aGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGgttg < 2:80181/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCAc > 2:620955/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCAcc < 1:1543861/150‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTTGGCATTGGGTAAATCTCGCCTGGCTCGCGGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTATTAAAGATGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAacc > 2:491503/1‑149 (MQ=255) gcTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCCAGCGTTacta < 2:578209/114‑4 (MQ=255) gcTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCCAGCGTTacta > 1:578209/1‑111 (MQ=255) gggTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTTGCATATTCCCCTCATCTTCTTAGTAACGCTGGGTTTATGCGCAATGTTTGGCTGGTTGTTGTCATCAGAAACAGTggg < 2:399278/149‑2 (MQ=255) ggTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGGTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGgca < 2:1250357/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTTCTATGTCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGgcag < 2:1389214/150‑1 (MQ=255) ggCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCAc > 1:843089/1‑150 (MQ=255) ggTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGAACCGCAAAt > 1:3349/1‑150 (MQ=255) aaaTCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTggg > 1:1671917/1‑108 (MQ=255) aaaTCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTggg < 2:1671917/108‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCCTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATctgctg < 2:602602/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGt > 1:568348/1‑150 (MQ=255) tggctggcGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAg > 1:687978/1‑150 (MQ=255) ggctggcGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGc < 2:137434/150‑1 (MQ=255) ctggcGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGa > 2:1147727/1‑150 (MQ=255) ggcggcGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGAcc < 1:161978/150‑1 (MQ=255) gcggcgTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCa < 2:807093/150‑1 (MQ=255) cggcgTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCAt < 2:1308064/150‑1 (MQ=255) gcgTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGc > 1:1337350/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGgc < 2:128525/150‑1 (MQ=255) gTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGgcgc > 2:1330059/1‑150 (MQ=255) cTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACTGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTc < 2:366040/150‑1 (MQ=255) tATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCt < 1:136337/150‑1 (MQ=255) aTGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGgcgc < 2:1632946/144‑1 (MQ=255) aTGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGgcgc > 1:1632946/1‑144 (MQ=255) gCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTAt > 1:930951/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTAtttt < 2:177231/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGATTCGCTGGCACATTCCCCTCTGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGGCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTAtttt < 2:948591/150‑1 (MQ=255) gCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTtgact > 2:7472/1‑150 (MQ=255) cGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTtgactg > 1:994616/1‑150 (MQ=255) gATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTtgactga > 1:388912/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGAcc > 2:446826/1‑150 (MQ=255) gCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCgg > 2:683245/1‑150 (MQ=255) cTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGt > 1:37145/1‑150 (MQ=255) cATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTAcc > 2:745461/1‑150 (MQ=255) atTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCt < 1:986858/150‑1 (MQ=255) ccccTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCt < 1:1381/150‑1 (MQ=255) cccTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTa > 1:481054/1‑150 (MQ=255) cccTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTa > 2:385116/1‑150 (MQ=255) cTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACg > 2:844665/1‑150 (MQ=255) tCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGa > 1:1403409/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGAc > 2:565736/1‑150 (MQ=255) aggttcttAGTATCGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCAGCAGAAACACTGGCAGCACCGCTAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCTTGCTCGTCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCTCTTCTACGAcc < 1:896606/147‑1 (MQ=255) 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ttAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGt < 1:1147727/150‑1 (MQ=255) aGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTgg < 2:930951/150‑1 (MQ=255) aGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCAACTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTgg > 1:1466594/1‑150 (MQ=255) gTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGgt < 2:996952/150‑1 (MQ=255) tAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTa > 2:1089222/1‑135 (MQ=255) tAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTa < 1:1089222/135‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGgtcgtc > 1:544022/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGGTCGTCt < 2:1337350/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCAACTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGGTCGTCt < 2:1466594/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGGTCGTCTTa < 1:432274/150‑1 (MQ=255) ggCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTa < 2:332431/128‑1 (MQ=255) ggCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTa > 1:332431/1‑128 (MQ=255) | ATTATGCAATATCCGATCTACAGCGGTATTCTGGCGGGCGCTGGTTGGCAATGGGTAAATCTCGCCTGGCTGGCTGGCGGCGTATGGTTGCTATGGCAGAAAGCGATTCGCTGGCATATTCCCCTCAGCTTCTTAGTAACGCTGGCGTTATGCGCAATGTTGGGCTGGTTGTTCTCACCAGAAACACTGGCAGCACCGCAAATTCATCTGCTGTCTGGAGCGACCATGCTCGGCGCATTCTTTATTTTGACTGACCCGGTTACCGCTTCTACGACCAATCGTGGTCGTCTTA > NC_000913/1709754‑1710045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |