| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,764,695 | 0 | A | G | 5.7% | 368.7 / 8.2 | 121 | intergenic (‑309/+18) | sufA/rydB | iron‑sulfur cluster insertion protein SufA/small regulatory RNA RydB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/56); new base G (2/5); total (60/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
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ccTTAAGCCTGTGTCGCACAGACTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTattatt > 1:870352/1‑150 (MQ=255) aaGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCGTAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg > 2:351539/1‑150 (MQ=255) aaGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACATAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg < 1:1243771/150‑1 (MQ=255) aaGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg < 2:961139/150‑1 (MQ=255) aaGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg > 2:115655/1‑150 (MQ=255) aGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGa < 1:509096/150‑1 (MQ=255) aGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGa < 2:1494625/150‑1 (MQ=255) tgtgtgCGACAGAGGCTTAAGGGTTTCTACCCGATCCGTCGCTTATCTACGGCACTCTCAGTGGCGTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATACTCTCATAAACCTATCCCCCCGTTTTAACACAAACTGGGATTAGTATTATTTTTGacc < 2:927269/148‑3 (MQ=255) tCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGaat < 2:986697/150‑2 (MQ=255) cTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATTTGTTTAATCTCATAATGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTTCTATTATTATTATTTTTGTAct < 2:990425/150‑2 (MQ=255) cTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCAATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTAGCAGTAGCTTAGCTATGGAAGGGGCGAGAAGAATAATGTCATAAAGCGAACACGCCGGTTTAACCAAAACTGCGATGAGGAAGAATTTTGaaga > 2:714956/1‑148 (MQ=255) gCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCCTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAatat > 2:1568919/1‑150 (MQ=255) | TTAGGTATCTCATTGTTAGATAATGGTTATTATCTAAGGAGCATTAAGGCTGTGATGAAAAAGAAAAAGTTGTATTGAAAATGACTATTTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGGTTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATAT > NC_000913/1764548‑1764841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |