Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,363,449 | T→C | 6.0% | D62G (GAT→GGT) ‡ | yfaY ← | IPR008135 CinA family protein YfaY |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,363,449 | 0 | T | C | 6.0% | 302.8 / 7.3 | 100 | D62G (GAT→GGT) ‡ | yfaY | IPR008135 CinA family protein YfaY |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/42); new base C (3/3); total (55/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.21e-01 |
CATTACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACAC > NC_000913/2363301‑2363597 | cATTACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATc > 2:188818/1‑150 (MQ=255) tACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGc < 2:303492/150‑1 (MQ=255) ctatttCCACGAACGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCg > 1:432984/6‑150 (MQ=255) aCTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCg > 1:1244378/1‑150 (MQ=255) aCTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCg > 2:902008/1‑150 (MQ=255) cGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc < 1:1605271/150‑1 (MQ=255) cGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc < 2:675091/150‑1 (MQ=255) cGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc < 2:919394/150‑1 (MQ=255) ccACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGa > 2:1629879/1‑150 (MQ=255) aCGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACt < 1:879207/150‑1 (MQ=255) cGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatcg < 1:1377629/150‑4 (MQ=255) cGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTa < 1:188818/150‑1 (MQ=255) cGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTa > 1:935054/1‑150 (MQ=255) gTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatcgt < 2:1389395/150‑5 (MQ=255) gTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatc > 2:1014826/1‑142 (MQ=255) gTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatc < 1:1014826/144‑3 (MQ=255) gTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGCTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc > 2:252451/1‑139 (MQ=255) gTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGCTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc < 1:252451/139‑1 (MQ=255) gAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAATTGATCGGTGTTGGGTCCCAGCGCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGGGTGGTGACTACGTTggcg < 2:371519/150‑1 (MQ=255) gAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTcgcg > 1:1170623/1‑150 (MQ=255) aaaTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCga > 2:542460/1‑150 (MQ=255) aaaTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCga > 1:909642/1‑150 (MQ=255) aaaTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCga > 1:1198333/1‑150 (MQ=255) gCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAAt < 2:972975/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAAt > 1:1351119/1‑150 (MQ=255) ttCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGt < 1:1100092/150‑1 (MQ=255) tcgaTCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGGACCATGCCTTCTCGTTTTGCTGTCGAAGCGGGGAGTGAGCTTAAATCATTTCTGGTCGGTCGCATCCGGCCTTTAACGATCAGAACATCGGGTTTCTGACTATGTTCTCGAAGTATGGTg < 2:1669550/147‑1 (MQ=255) tCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTg < 1:1394191/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATCGTg > 1:1587452/1‑150 (MQ=255) ccATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGa > 1:228022/1‑150 (MQ=255) tctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAg > 2:1623085/1‑150 (MQ=255) ctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGt < 2:555531/150‑1 (MQ=255) ctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGt > 2:566136/1‑150 (MQ=255) ctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGt > 1:784151/1‑150 (MQ=255) tGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTATATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGtcat < 2:1179793/150‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGtcat > 2:1397075/1‑150 (MQ=255) aGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGt > 2:1365135/1‑150 (MQ=255) aGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGt < 1:1397075/150‑1 (MQ=255) ggCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGtt > 1:304893/1‑150 (MQ=255) ggCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAACCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGtt > 1:1342486/1‑150 (MQ=255) cTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTAt > 1:301626/1‑150 (MQ=255) ttCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATc > 1:516349/1‑150 (MQ=255) cATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATccc > 2:454375/1‑150 (MQ=255) gcagcaCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCa > 1:126713/1‑150 (MQ=255) gcagcaCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCa > 2:1347412/1‑150 (MQ=255) caccacGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGCTTATCCCCCACCGt > 2:568547/1‑150 (MQ=255) caCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGt < 1:902008/150‑1 (MQ=255) caCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCAAATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGt > 2:532648/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTAt > 2:1576979/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTAt > 1:1327901/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTAtt > 2:564975/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTg < 1:546475/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTgc > 1:875105/1‑150 (MQ=255) gCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTgcg < 2:1333313/150‑1 (MQ=255) ccTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGAt > 1:145069/1‑150 (MQ=255) ccTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGAt > 2:1362624/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCTATCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTAt > 1:964848/1‑126 (MQ=255) cTTTTGCTATCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTAt < 2:964848/126‑1 (MQ=255) ttGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATg < 2:1351119/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATgg < 1:1365135/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGc < 1:863878/150‑1 (MQ=255) gTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAAGGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCGCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAc < 2:516349/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAcccc > 2:1404039/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAcccc < 1:1623085/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAcccc < 2:1170623/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAcccc < 2:909642/150‑1 (MQ=255) cgcTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGaaaa > 1:718656/1‑150 (MQ=255) cgcTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGaaaa > 2:1659860/1‑150 (MQ=255) cTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGaaaaaa > 2:1531354/1‑150 (MQ=255) tAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATc < 1:1531354/150‑1 (MQ=255) aaaTCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCg < 1:532648/150‑1 (MQ=255) atcatcGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgc > 1:677175/1‑150 (MQ=255) catcGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgcca < 2:1537334/150‑1 (MQ=255) catcGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgcca > 1:1286166/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgccagcca > 2:1128113/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgccagcca < 1:1362624/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGccagccag < 1:454375/150‑1 (MQ=255) tcggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCtgat < 1:390122/123‑1 (MQ=255) tcggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCtgat > 2:390122/1‑123 (MQ=255) tcggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAg < 1:1022463/150‑1 (MQ=255) ggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCg > 2:779497/1‑150 (MQ=255) gtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGt < 2:1198333/150‑1 (MQ=255) cccAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTa < 2:432984/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAg > 2:1050256/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAAGCGGCCAGCCGGGCAGCGTTAg > 1:1457813/1‑150 (MQ=255) aGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAgtg < 1:1659860/150‑1 (MQ=255) gCCCGCCGTTAACGATCAGCCCATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAgtgt > 2:793450/1‑150 (MQ=255) gccgTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAAc < 2:228022/150‑1 (MQ=255) gccgTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAAc < 1:1404039/150‑1 (MQ=255) aCGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAGAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGc > 1:343826/1‑150 (MQ=255) tagtCAGCACGCCGATGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc > 1:562785/4‑150 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAGCCATGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc < 2:1587452/150‑1 (MQ=255) gATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGccc > 1:406524/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGccc > 1:1543753/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGccc > 2:145364/1‑150 (MQ=255) gtCAGCACGCCGATGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCCCCGTATTGCGGCGAGATAATGGCACCCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCg > 1:625988/2‑150 (MQ=255) aTCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCg < 2:935054/150‑1 (MQ=255) acaTCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAac < 2:1244378/150‑1 (MQ=255) caTCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAaca > 1:1491488/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAacac < 1:21957/150‑1 (MQ=255) | CATTACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACAC > NC_000913/2363301‑2363597 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |