| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,399,878 | C→G | 8.0% | M96I (ATG→ATC) ‡ | nuoG ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit G |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,399,878 | 0 | C | G | 8.0% | 279.0 / 11.0 | 85 | M96I (ATG→ATC) ‡ | nuoG | NADH:quinone oxidoreductase subunit G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/35); new base G (2/5); total (45/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAGAGATGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACATCACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGCTTCACCGCACACT > NC_000913/2399730‑2400026 | gagagaTGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGtca < 1:974658/150‑1 (MQ=255) gagaTGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGtcatc > 1:481157/1‑150 (MQ=255) gagaTGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGtcatc > 1:702399/1‑150 (MQ=255) gagaTGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAAAGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGtcatc < 2:467833/150‑1 (MQ=255) tGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAAcc > 1:1312810/1‑150 (MQ=255) tGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAAcc < 1:113531/150‑1 (MQ=255) gAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCa < 1:72354/150‑1 (MQ=255) gAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCa > 2:1627217/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCaagccc > 2:214261/1‑146 (MQ=255) tGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTc > 1:1195011/1‑150 (MQ=255) tGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGATGACCAACCAccc < 2:458352/150‑3 (MQ=255) ggCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGATGACCAACCACCCg < 1:1455829/150‑1 (MQ=255) gCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGAGTGGTTGATGACCAACCACCCgc < 1:1521467/150‑2 (MQ=255) gCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGAGTGGTTGATGACCAACCACCCgc < 1:1515291/150‑2 (MQ=255) ccAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCa < 2:638630/150‑1 (MQ=255) cAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGATGACCAACCACCCgcacga < 1:1260757/150‑6 (MQ=255) cTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTc > 1:483423/1‑150 (MQ=255) tACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGa < 2:905430/150‑1 (MQ=255) 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gtcgagtggtTGATGACCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACATCACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGc > 2:1211136/6‑150 (MQ=255) tcgagtggtTGATGACCACCCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACATCACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGCt > 1:821771/5‑150 (MQ=255) gCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACATCACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGCt < 2:481157/150‑1 (MQ=255) gggTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACATCACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGCTTc < 2:1151612/150‑1 (MQ=255) gggTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACAT‑ACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGCTTCa < 2:1195011/150‑1 (MQ=255) 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GAGAGATGAATGGCCCCAAATCCTGATTACGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGTAGCGACGGAAGCTGTGTCCGGTCATCACAGTCATATCCTGAAGATGGCAGTTACCGCCCTCTTCACATACCGGACAGTCGTGCGGGTGGTTGGTCATCAACCACTCGACCACGCTTTCACGGAACTGTTTCGCTTCTTCGTCGTCAATGGAAATAAAGGTGCCATCGGAAGCCGGTGTCATACAGGACATCACCAGGCGACCACGCGTGTCTTCCGCGTTTTGGTATTGCTTCACCGCACACT > NC_000913/2399730‑2400026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |