| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,486,798 | G→T | 8.2% | A809S (GCA→TCA) | evgS → | sensory histidine kinase EvgS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,486,798 | 0 | G | T | 8.2% | 225.3 / 5.1 | 70 | A809S (GCA→TCA) | evgS | sensory histidine kinase EvgS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/34); new base T (4/2); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCTCGGCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGG > NC_000913/2486656‑2486940 | cctcGGCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCTCATTAAg > 2:80210/1‑150 (MQ=255)cctcGGCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCTCATTAAg > 2:86201/1‑150 (MQ=255) tcGGCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTATAGTCCAGAACACTAGTCACTCTTTCGGAGCGATTGCTGAAAGAAAATAGAGCTCAGTAAGtt > 1:733677/1‑150 (MQ=255) ggCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTgc < 2:42828/150‑1 (MQ=255) ggCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTgc < 1:991357/150‑1 (MQ=255) ttAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTgcagc < 2:951619/150‑1 (MQ=255) aaTTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGcagcag > 1:1666407/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGt < 1:779486/150‑1 (MQ=255) ggTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACg > 1:1321046/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGt > 2:1658597/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTc < 1:1507271/150‑1 (MQ=255) aaTCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTcc < 1:1615235/150‑1 (MQ=255) tCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTg < 2:88052/150‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGa < 2:373415/150‑1 (MQ=255) ttGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAAc < 1:1136738/150‑1 (MQ=255) tGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACa < 2:875582/150‑1 (MQ=255) aTGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCGAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACAtt > 2:1163629/1‑150 (MQ=255) tGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTa > 2:63818/1‑150 (MQ=255) gACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTg > 1:886035/1‑150 (MQ=255) gACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTg < 2:1140055/150‑1 (MQ=255) gACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTg > 1:1009884/1‑150 (MQ=255) ttGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGa < 2:609501/150‑1 (MQ=255) tGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGAt < 1:163604/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCg > 2:1346409/1‑150 (MQ=255) tCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCTCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGAc < 1:80210/150‑1 (MQ=255) tCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCTCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGAc < 1:86201/150‑1 (MQ=255) tCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGAc < 2:1222358/150‑1 (MQ=255) tCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGAc < 2:1645887/150‑1 (MQ=255) gggTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGAccc > 1:350565/1‑150 (MQ=255) ggTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCt > 1:317818/1‑150 (MQ=255) tAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCa < 1:717620/150‑1 (MQ=255) tCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGtt < 2:1321372/150‑1 (MQ=255) cAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAg > 1:1418365/1‑150 (MQ=255) aaCCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCACTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAgg < 2:743595/150‑1 (MQ=255) ccACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTc > 2:1295/1‑150 (MQ=255) gggTCGATATCCCTACTATAGTCAAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATATCATTAAGTTGCAGCAGTACCTATCCTGAACATTAACTGGTTAAGATCGACCCTCAGAAGATTAAGCAGGTCTAATaaa > 2:882510/1‑150 (MQ=255) atatCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTAc < 2:1422967/150‑1 (MQ=255) ccTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt < 2:843154/150‑1 (MQ=255) cTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATg < 1:1185931/150‑1 (MQ=255) tAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGctc < 2:317818/150‑1 (MQ=255) gTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCtctc > 2:378111/1‑150 (MQ=255) gTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCtctc > 1:559331/1‑150 (MQ=255) gTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCtctc > 2:513832/1‑150 (MQ=255) cAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCaaa < 1:788948/150‑1 (MQ=255) aGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCa < 1:1083455/125‑1 (MQ=255) aGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCa > 2:1083455/1‑125 (MQ=255) gAACACTTGTCACTATTTCGGTGCGATTTCTGCAAGAAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGAAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAAtt > 2:1186642/1‑150 (MQ=255) cTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca > 2:334159/1‑150 (MQ=255) attGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca > 1:1087497/2‑150 (MQ=255) tGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt > 1:409158/1‑129 (MQ=255) tGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGt < 2:409158/129‑1 (MQ=255) gTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCg > 2:1594044/1‑150 (MQ=255) gTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCg < 2:692238/150‑1 (MQ=255) aCTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAgg > 2:318141/1‑150 (MQ=255) ctctTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAggg > 1:1099786/1‑150 (MQ=255) ctctTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAggg > 1:200275/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCGATTGCTGAAATCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGAAGTACGTTACCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGAGTTTAAGAAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCAACGAGGGGGCAg > 2:1585226/1‑150 (MQ=255) gCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGAAGGTCTTATCAAATTTACTGATTAATGCTCTCAAATTTAACAACCAGGCGGCAGTaaaa > 1:723106/1‑150 (MQ=255) gctgcGAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACg < 1:1163629/150‑1 (MQ=255) ctgcAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGCTTAAGATCGACCATCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACAACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGa > 1:1226474/1‑150 (MQ=255) gcaagcaaATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGAcc < 2:838833/150‑1 (MQ=255) gcaaATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTccc < 2:1009884/150‑1 (MQ=255) aaaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTg < 1:513832/150‑1 (MQ=255) aaaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTg < 1:318141/150‑1 (MQ=255) aaaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTg < 2:886035/150‑1 (MQ=255) aaTCGCTCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGCCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTgg > 2:48680/1‑150 (MQ=255) aaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCATGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTgg < 1:63818/150‑1 (MQ=255) aaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTgg < 1:378111/150‑1 (MQ=255) aaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTgg > 1:565860/1‑150 (MQ=255) aaTCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGATTAAGCAGCTCTTATCAAATTTACTGACTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTgg > 1:408904/1‑150 (MQ=255) atcgatcgCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTggg < 1:1295/150‑1 (MQ=255) | CCTCGGCTTAATTGGTGAAATCCTTGATGTCGACAAAATTGAATCGGGTAACTATCAACTTCAACCACAATGGGTCGATATCCCTACTTTAGTCCAGAACACTTGTCACTCTTTCGGTGCGATTGCTGCAAGCAAATCGATCGCATTAAGTTGCAGCAGTACGTTTCCTGAACATTACCTGGTTAAGATCGACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGG > NC_000913/2486656‑2486940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |