Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,504,192 | T→A | 6.0% | A98A (GCA→GCT) | fryA ← | putative PTS multiphosphoryl transfer protein FryA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,504,192 | 0 | T | A | 6.0% | 270.6 / 5.4 | 83 | A98A (GCA→GCT) | fryA | putative PTS multiphosphoryl transfer protein FryA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/41); new base A (2/3); total (39/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 |
TGGCGGGGATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGA > NC_000913/2504044‑2504341 | tGGCGGGGATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTctg < 2:1539150/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTctg < 2:1544881/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTctgc > 2:1247896/1‑150 (MQ=255) ggggATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTctgcctg < 1:1073475/150‑1 (MQ=255) ggggATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTctgcctg < 1:1325458/150‑1 (MQ=255) gCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCg > 1:1379633/1‑145 (MQ=255) gCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCg < 2:1379633/145‑1 (MQ=255) cccGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCt < 2:140265/150‑1 (MQ=255) ccGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTg > 2:434848/1‑150 (MQ=255) aTAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCAGCCTACGCAGGCAGAAc < 1:81157/150‑1 (MQ=255) tAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCAGCCTACGCAGGCAGAAct < 1:1257317/150‑2 (MQ=255) aaCTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTGAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAAcgc > 2:1522023/1‑150 (MQ=255) aCTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAAcgct > 1:1422795/1‑150 (MQ=255) tGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCAGCCTACGCAGGCAGAActgacg > 2:1049438/1‑145 (MQ=255) gTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAAcgctgtc > 2:175381/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCAGCCTACGCAGGCAGAActgacgg < 1:1049438/150‑7 (MQ=255) cGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAAcgctgtcgc > 1:630363/1‑150 (MQ=255) cGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAAcgctgtcgc < 1:1515620/150‑1 (MQ=255) gAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAAcgctgtcgct < 1:697599/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACgctgtcgctgtc < 1:161015/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACgctgtcgctgtc > 1:118139/1‑150 (MQ=255) gTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGAt > 1:314847/1‑150 (MQ=255) gTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGAt < 2:1062547/150‑1 (MQ=255) gTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGAt > 1:607808/1‑150 (MQ=255) tttGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAgc < 1:675072/150‑1 (MQ=255) tttGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAgc < 1:670778/150‑1 (MQ=255) tttGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAgc < 1:1239962/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCAcc > 1:328068/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCAcc > 1:1256162/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTg > 2:238841/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGAt > 2:1187351/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACgctgtcgctgtc < 2:531595/131‑1 (MQ=255) gTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACgctgtcgctgtc > 1:531595/1‑131 (MQ=255) tCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTGAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGt < 1:1522023/150‑1 (MQ=255) cAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCTAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTa < 2:65992/150‑1 (MQ=255) aGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTAc < 1:109216/150‑1 (MQ=255) aGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTAc > 2:61876/1‑150 (MQ=255) aGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTAc > 2:640896/1‑150 (MQ=255) tACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCtt > 2:1603500/1‑150 (MQ=255) cccACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTcc < 2:1197633/150‑1 (MQ=255) cccACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTcc > 2:20076/1‑150 (MQ=255) cccACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTcc > 2:800309/1‑150 (MQ=255) cccACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTcc > 1:598789/1‑150 (MQ=255) cACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAg > 1:250598/1‑150 (MQ=255) cACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAg > 2:552657/1‑150 (MQ=255) cgccgacgccgCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCa < 1:839255/150‑1 (MQ=255) cgccgacgccgCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCa > 1:320219/1‑150 (MQ=255) cgcTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCAcgcgccgcg < 1:434848/150‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACgcgccgcgcc < 1:44194/150‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACgcgccgcgcc < 1:20076/150‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACgcgccgcgcc < 1:600882/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTg < 2:1191277/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTg < 2:1524147/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTg > 1:165431/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGc > 2:4437/1‑150 (MQ=255) tGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGc < 2:475635/150‑1 (MQ=255) ccGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTg < 2:1596234/150‑1 (MQ=255) ccGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTg < 2:784997/150‑1 (MQ=255) tACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCg > 2:386239/1‑150 (MQ=255) 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aaaTCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATg < 2:1256162/150‑1 (MQ=255) tCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTc < 1:175381/150‑1 (MQ=255) ggTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGc < 2:978538/150‑1 (MQ=255) cTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCa > 2:936650/1‑150 (MQ=255) cTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCa < 2:607808/150‑1 (MQ=255) 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gcgGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAggg < 2:118139/150‑1 (MQ=255) gcgGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAggg < 1:4437/150‑1 (MQ=255) cgGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGggt > 1:1663401/1‑150 (MQ=255) aGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGggtgccg > 2:845291/1‑150 (MQ=255) cGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGggtgccggt < 1:974535/150‑1 (MQ=255) aTGCGCCGTGAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGggtgccggtgcc < 1:1454215/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCa > 1:1428100/1‑150 (MQ=255) acagcgTTCAGCCTACGCAGGCAGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAg > 2:141925/6‑150 (MQ=255) gTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGggtg > 1:148277/1‑135 (MQ=255) gTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGggtg < 2:148277/135‑1 (MQ=255) cAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCGgcgc > 2:971096/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGcc > 1:1128586/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGcc > 1:1502105/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGcc < 2:328068/150‑1 (MQ=255) tgcctgcGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGa > 2:479359/1‑150 (MQ=255) | TGGCGGGGATTGCCCGATAACTGTCGAGGCTGTCGCTTTGTAACAGGGTCAGCGTACCCACGCCGACGCCGCTTGCCAGCACATTGCCGTACAGTAAATCCGGGTTAAGGCGGCTTAATGAACGCGGCAGCGGATGCGCCGTCAGTTCTGCCTGCGTAGGCTGAACGCTGTCGCTGTCGATAAAGCGCACCTGGATGTACTCTTCCAGCACGCGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGA > NC_000913/2504044‑2504341 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |