Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,620,220 | A→G | 9.5% | intergenic (‑60/+26) | uraA ← / ← upp | hypothetical protein/uracil phosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,620,220 | 0 | A | G | 9.5% | 296.7 / 17.8 | 105 | intergenic (‑60/+26) | uraA/upp | hypothetical protein/uracil phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/43); new base G (8/2); total (60/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.49e-01 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTCCAGC > NC_000913/2620072‑2620369 | ccAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTaaa > 1:1488282/1‑150 (MQ=255) aaCATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGCTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAGCCGAATCTTAAAGTc > 2:536511/1‑150 (MQ=255) ggCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCtt > 1:1273273/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |