| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 388,674 | C→A | 5.1% | intergenic (+28/+79) | tauD → / ← hemB | taurine dioxygenase/porphobilinogen synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 388,674 | 0 | C | A | 5.1% | 328.3 / 5.0 | 97 | intergenic (+28/+79) | tauD/hemB | taurine dioxygenase/porphobilinogen synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/42); new base A (3/2); total (53/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TATTGCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATCCGCACCCGCACGC > NC_000913/388526‑388822 | tatTGCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCt < 2:1013099/150‑1 (MQ=255) ttGCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTg > 2:254113/1‑150 (MQ=255) ttGCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTg < 2:753714/150‑1 (MQ=255) tGCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTgg < 2:1206262/150‑1 (MQ=255) gCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTggg < 2:1298603/150‑1 (MQ=255) gATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCTACCGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAGCCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGga > 2:263452/1‑150 (MQ=255) aTTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGgag < 2:454403/150‑1 (MQ=255) ttGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGagag > 2:252806/1‑150 (MQ=255) ttGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGagag < 1:206888/150‑1 (MQ=255) tGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCTCCCCAAGGGGGCGAgg < 1:1086112/150‑1 (MQ=255) gggATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAggg > 1:845898/1‑150 (MQ=255) tAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTAATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGCGACAGGGTTAg > 2:1476173/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCGGGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAg < 2:1368422/149‑1 (MQ=255) aCCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAggg > 2:1088786/1‑150 (MQ=255) cgcgTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTg < 2:34785/150‑1 (MQ=255) gTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAgg < 2:811790/150‑1 (MQ=255) gACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAgggg > 2:619498/1‑150 (MQ=255) gACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGAATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGCGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGAAGAGAGGGTTAGGGTGAgggg > 2:710776/1‑150 (MQ=255) 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ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCa > 2:1341437/1‑150 (MQ=255) ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCa < 2:1021001/150‑1 (MQ=255) ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAAGCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATcc > 1:181214/1‑149 (MQ=255) ccctaacccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGa > 1:1005534/7‑150 (MQ=255) cGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCGCTTTGTGAGAGGAAAGAAAATTAACGCAGAATATTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGGAAATTAGCTGAAAATCAGAt < 2:314204/150‑1 (MQ=39) cGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGAt > 1:261865/1‑150 (MQ=255) gTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGTTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATcc < 1:849168/150‑1 (MQ=255) acccTCTCCCCAAGGGGGCGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgc > 2:1213857/2‑150 (MQ=255) cccTCTCCCCAAGGGGGCGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgca > 1:818632/1‑150 (MQ=255) cccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgca > 2:371216/1‑150 (MQ=255) cccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgca > 2:1037387/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgcac > 2:510213/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgcacc < 1:1658284/150‑1 (MQ=255) cccccTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATccgcacccgca > 1:53845/1‑150 (MQ=255) cccTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATCCGCACCCGCACg < 2:205822/150‑1 (MQ=255) cccTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATCCGCACCCACACg > 1:935210/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATCCGCACCCGCACGc > 2:755356/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATCCGCACCCGCACGc < 1:1222420/150‑1 (MQ=255) | TATTGCGATTTGGGATAACCGCGTGACCCAGCACTATGCCAATGCCGATTACCTGCCACAGCGACGGATAATGCATCGGGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGCGCAAAGTAGCTGAAAATCAGATCCGCACCCGCACGC > NC_000913/388526‑388822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |