| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,917,910 | T→C | 5.9% | intergenic (+97/+135) | barA → / ← gudD | sensory histidine kinase BarA/D‑glucarate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,917,910 | 0 | T | C | 5.9% | 368.8 / 9.3 | 118 | intergenic (+97/+135) | barA/gudD | sensory histidine kinase BarA/D‑glucarate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/64); new base C (3/4); total (50/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATG > NC_000913/2917762‑2918057 | gTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATAACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTa > 1:169068/1‑150 (MQ=255) tGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATc > 2:169809/1‑150 (MQ=255) cGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGc > 2:1398419/1‑150 (MQ=255) cGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGc < 1:406910/150‑1 (MQ=255) cGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGc < 2:750775/150‑1 (MQ=255) gagaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCGTTATATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACATAGTGCCTGTGGTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGcc < 2:586885/150‑1 (MQ=255) agaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCTGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCt < 1:937214/150‑1 (MQ=255) agaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGcat < 2:442559/150‑3 (MQ=255) tGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACa < 1:406611/150‑1 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaa > 2:882104/1‑150 (MQ=255) gATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaaa > 1:849467/1‑150 (MQ=255) tAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc > 1:401157/1‑150 (MQ=255) cgcgcgcgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTa > 2:1308458/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAAtt < 1:286147/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTc < 2:797553/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTc < 2:680387/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTc < 1:65641/150‑1 (MQ=255) cgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCa < 1:813871/150‑1 (MQ=255) cgAAGCCAGCAAAATTCTCAGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCa > 1:383528/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAAt < 2:125169/150‑1 (MQ=255) ccAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGaa < 1:1276010/150‑1 (MQ=255) ccAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGaa > 1:392751/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAt < 2:311396/150‑1 (MQ=255) cAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaa < 1:932405/150‑1 (MQ=255) cAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaa < 1:926493/150‑1 (MQ=255) aaaTTCTCTGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaaaa < 2:390624/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaaaaa < 1:637020/150‑1 (MQ=255) ttCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAat > 1:1106624/1‑150 (MQ=255) ttCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAat < 1:1308458/150‑1 (MQ=255) tctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatg < 1:1100980/150‑1 (MQ=255) tctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatg < 2:1514617/150‑1 (MQ=255) ctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatga < 1:764401/150‑1 (MQ=255) ctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatga > 2:1620160/1‑150 (MQ=255) ctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatga < 2:299224/150‑1 (MQ=255) tcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgat < 2:1079472/150‑1 (MQ=255) cGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATAACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgatg < 2:169068/150‑1 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt < 1:1561276/150‑1 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt < 1:1331173/150‑1 (MQ=255) gTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAg > 1:208020/1‑150 (MQ=255) aaTGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGTCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGAc > 1:545005/1‑150 (MQ=255) ggATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTg > 2:646937/1‑150 (MQ=255) aTGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGAt < 2:1240851/150‑1 (MQ=255) gTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATAc < 2:1020573/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACAt > 1:300181/1‑150 (MQ=255) tGTCGAGTAGCATTCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGACTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATac > 2:623484/1‑149 (MQ=255) tGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGTCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAg > 2:499180/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGc > 2:1199837/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGc > 2:357045/1‑150 (MQ=255) tCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGca < 2:1245555/150‑1 (MQ=255) cGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcac < 2:401157/150‑1 (MQ=255) aGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCacaa > 1:253924/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTa > 1:1662478/1‑150 (MQ=255) cTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg > 1:1496851/1‑150 (MQ=255) ttttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACATGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCg < 2:1477659/150‑1 (MQ=255) tttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGt < 1:1297255/150‑1 (MQ=255) ttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGtt < 1:1641830/150‑1 (MQ=255) tATGACGCTGGTTTCAGATTGGTTACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGttt < 2:1411449/150‑1 (MQ=255) tATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGTCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGttt < 1:499180/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATTAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAg < 1:1345085/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCa < 2:262683/150‑1 (MQ=255) tGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAg < 2:423946/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGTCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtc < 2:545005/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtc < 2:1106624/150‑1 (MQ=255) ttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTCTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtctc < 2:196832/150‑1 (MQ=255) tCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATa < 1:1660262/110‑1 (MQ=255) tCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATa > 2:1660262/1‑110 (MQ=255) cAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCaa > 1:595432/1‑150 (MQ=255) aGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCaaa > 1:933561/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTGCAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAAcc < 1:1119926/150‑1 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAAcc > 1:1421770/1‑150 (MQ=255) ttGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCg > 1:1047919/1‑150 (MQ=255) gACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTcc > 1:548613/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCa < 2:849467/150‑1 (MQ=255) cAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAg > 2:1029946/1‑150 (MQ=255) gTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCTCAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATag < 2:1430831/150‑1 (MQ=255) ccTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGc > 1:91960/1‑150 (MQ=255) cTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGcc < 1:1398419/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCg > 2:1007591/1‑150 (MQ=255) tgtTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggt > 1:225775/1‑150 (MQ=255) gtTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGAAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtt < 2:84942/150‑1 (MQ=38) taggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg > 2:647339/4‑150 (MQ=255) taggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg > 1:1249099/4‑150 (MQ=255) tATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttga < 2:383528/150‑3 (MQ=255) tATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg < 1:882104/150‑1 (MQ=255) aggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg > 2:640919/3‑150 (MQ=255) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg < 1:1199837/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg < 2:300181/150‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggt > 2:510631/1‑150 (MQ=255) ccGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggttt < 2:1232194/150‑1 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc < 1:357045/150‑1 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc < 1:1004401/150‑1 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc > 1:576420/1‑150 (MQ=255) cggcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCt < 2:1421770/150‑1 (MQ=255) ggcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATCCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTGTGTCtt > 2:277867/1‑150 (MQ=255) gTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAAc < 2:392751/150‑1 (MQ=255) gTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAAc > 2:804807/1‑150 (MQ=255) cGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATAAAAAAATGATGTAGACATGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTATAGCAACAGACTCAAAACGGCTCCAGAAAGAGCCGCTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCAcc > 2:1098374/1‑150 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCa > 1:1385976/1‑150 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATg > 1:1652846/1‑150 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATg > 1:1658661/1‑150 (MQ=255) | GTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATG > NC_000913/2917762‑2918057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |