| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,942,593 | A→C | 5.7% | intergenic (‑26/‑103) | gcvA ← / → gcvB | DNA‑binding transcriptional dual regulator GcvA/small regulatory RNA GcvB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,942,593 | 0 | A | C | 5.7% | 333.7 / 10.4 | 105 | intergenic (‑26/‑103) | gcvA/gcvB | DNA‑binding transcriptional dual regulator GcvA/small regulatory RNA GcvB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/44); new base C (4/2); total (59/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
ATTTGATGACTTACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGT > NC_000913/2942446‑2942742 | atttgatGACTTACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAATCTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAAt < 2:1385760/150‑1 (MQ=255) tttgatGACTTACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAAtt > 2:1463199/1‑150 (MQ=255) tttgatGACTTACTGCGGCGTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAAtt < 2:533847/150‑1 (MQ=255) aCTTACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAAt < 2:1326946/150‑1 (MQ=255) aCTTACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAAt > 1:1657723/1‑150 (MQ=255) ttACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCTAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTa < 1:29907/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATTCATTTAACatcaaagt < 1:469987/150‑8 (MQ=255) cTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGAt > 2:1404679/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATc < 2:43274/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATcac < 1:822912/150‑1 (MQ=255) gCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCacac > 1:829442/1‑150 (MQ=255) ttGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTa < 1:1323730/150‑1 (MQ=255) gggTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATg < 1:1330006/150‑1 (MQ=255) gggTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATg < 2:357186/150‑1 (MQ=255) gTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTCCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGCTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTa > 2:1136842/1‑150 (MQ=255) tCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATc < 2:711428/139‑1 (MQ=255) tCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTaa > 1:1318999/1‑150 (MQ=255) cacaAAAAGCTCTTCTTCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGTCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGTCATTTAGCGGTTGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAAc < 1:694549/150‑1 (MQ=255) acaAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAAcc < 2:374082/150‑1 (MQ=255) caAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATATAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACATTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCt > 2:1091041/1‑150 (MQ=255) aaGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTa > 1:1224187/1‑150 (MQ=255) aaGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTAAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTa < 1:1637962/150‑1 (MQ=255) aaGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTAAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTa < 1:1632459/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGttttttt < 2:485065/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGttttttt > 2:1528198/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTa < 2:1199547/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTa < 2:322212/150‑1 (MQ=255) tgcGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATc > 1:1651161/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCt < 2:559017/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCt > 1:783791/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCt > 1:1440279/1‑150 (MQ=255) gTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCa > 1:1434321/1‑150 (MQ=255) aaaCTTAAATGTCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATta < 1:1505975/150‑1 (MQ=255) aaCTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATtat < 2:314292/150‑1 (MQ=255) aCTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATtata > 1:296295/1‑150 (MQ=255) cTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATaa > 1:1365245/1‑150 (MQ=255) tAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAAt > 2:806653/1‑150 (MQ=255) tgctgcGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTg < 1:63805/150‑1 (MQ=255) gctgcGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGa < 2:707718/150‑1 (MQ=255) tgcGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGc < 1:210667/150‑1 (MQ=255) tcGGCATTAAAAACTCTTAAGTAATTTAGGTGTGGTAATCTTTTATACATTGCTATTAAACTTTGATGTTAAATTAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTATTTTTTTTAATCTGATCAATTATAAATTGTACGTTGAGCt < 2:426687/149‑1 (MQ=255) aTCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTCGAGCTTCTAc > 1:483209/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAg > 1:834857/1‑150 (MQ=255) tAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCt > 1:327986/1‑150 (MQ=255) aGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCtat > 2:476396/1‑150 (MQ=255) ggCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCtata > 1:1319820/1‑150 (MQ=255) cATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGt > 1:814117/1‑150 (MQ=255) tAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTggcg > 1:1097596/1‑150 (MQ=255) aGCGGTGGTAATCCATTAGACATCGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACAATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTAACAGCAAATAACTATAGTggcgg > 2:599549/1‑150 (MQ=255) gtAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTGTACCAGCAAATCCCTATAGTGGCGGCACTTcc < 1:1136842/150‑1 (MQ=255) gtAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTcc < 2:783791/150‑1 (MQ=255) gtAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTcc < 1:1463199/150‑1 (MQ=255) gtAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTcc > 2:160367/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTg > 1:1106702/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTg > 2:1455661/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTg > 2:504047/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTg < 2:827688/150‑1 (MQ=255) cGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGc > 1:7792/1‑150 (MQ=255) tttAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTATTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCg < 1:636641/150‑1 (MQ=255) tttAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCg < 2:806010/150‑1 (MQ=255) ttAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCgg < 2:834857/150‑1 (MQ=255) aGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCtata < 1:284709/126‑1 (MQ=255) aGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCtata > 2:284709/1‑126 (MQ=255) aGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAACCGGaa > 2:591118/1‑150 (MQ=255) aGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATAACTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGaa > 2:717966/1‑150 (MQ=255) cATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGa < 2:1286693/150‑1 (MQ=255) gCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAg > 2:1328801/1‑150 (MQ=255) cTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGt < 2:1651161/150‑1 (MQ=255) cTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGt > 2:747844/1‑150 (MQ=255) aTTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGttt < 1:720399/150‑1 (MQ=255) aTTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGttt > 2:1626045/1‑150 (MQ=255) aTTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCAGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACATATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGttt > 1:1645111/1‑150 (MQ=255) tAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTa < 1:1216686/150‑1 (MQ=255) acaCTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCCGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTAt < 2:836546/148‑1 (MQ=255) aaaCTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTAt > 2:727119/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATc > 2:261770/1‑150 (MQ=255) atctaattGTTAAATTCATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCg > 2:218451/8‑150 (MQ=255) ctaattGTTAAATTCATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGa > 1:1463909/6‑150 (MQ=255) ttGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTATAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACATATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTAATCGGaa > 2:524727/1‑150 (MQ=255) taattGTTAAATTCATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGaa > 2:118820/5‑150 (MQ=255) tGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAAt < 2:296295/150‑1 (MQ=255) gATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATg < 2:1318999/150‑1 (MQ=255) attGTTAAATTCATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCg < 1:1596408/125‑1 (MQ=255) attGTTAAATTCATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCg > 2:1596408/3‑127 (MQ=255) tGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCg > 2:1314217/1‑150 (MQ=255) tGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCg > 1:988612/1‑150 (MQ=255) tAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCgtgt > 1:899466/1‑150 (MQ=255) tAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGAGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCgtgt > 2:1327702/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTGGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGtt > 2:1195534/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAAc < 1:777551/125‑1 (MQ=255) aaaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAAc > 2:777551/1‑125 (MQ=255) aaaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGtt > 2:458294/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGtt > 2:875462/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATTTAACAATTAGATCACACTAAGTAAACTATTAGTTTTTTTAATCTCAGCCATTATAAATTGACCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACATATAGTCGCGGCACTTACTGAGCCGGAACGAAAACTTTTATCGGAATGCGTGtt > 2:66710/1‑150 (MQ=255) aaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTcc > 1:535379/1‑113 (MQ=255) aaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTcc < 2:535379/113‑1 (MQ=255) aaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTc > 2:1302901/1‑150 (MQ=255) tGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTg > 1:762203/1‑150 (MQ=255) gAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTgg < 1:476396/150‑1 (MQ=255) aaTTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGt < 1:1404679/150‑1 (MQ=255) | ATTTGATGACTTACTGCGGCTTGGGTCACAAAAAGCTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGT > NC_000913/2942446‑2942742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |