| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,125,308 | C→T | 5.5% | R51H (CGC→CAC) | glcF ← | glycolate dehydrogenase, putative iron‑sulfur subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,125,308 | 0 | C | T | 5.5% | 226.2 / 2.1 | 72 | R51H (CGC→CAC) | glcF | glycolate dehydrogenase, putative iron‑sulfur subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/39); new base T (2/2); total (31/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
ATCACGCCCGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGG > NC_000913/3125160‑3125452 | atCACGCCCGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATgcg > 1:462502/1‑150 (MQ=255)atCACGCCCGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATgcg > 1:497713/1‑150 (MQ=255)atCACGCCCGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATgcg > 1:700021/1‑150 (MQ=255) cACGCCCGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGTGcc > 1:745843/1‑150 (MQ=255) ccGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCcgcgc < 1:306899/150‑1 (MQ=255) atatCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGc < 2:549048/150‑1 (MQ=255) tatCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGcc < 2:1479579/150‑1 (MQ=255) cAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTc > 1:1508002/1‑150 (MQ=255) aGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTcc > 2:1139570/1‑150 (MQ=255) gCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCa < 1:1203704/150‑1 (MQ=255) tAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGTGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGccc > 1:1408207/1‑150 (MQ=255) tAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGccc > 2:1428695/1‑150 (MQ=255) tAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGccc < 2:811180/150‑1 (MQ=255) aGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCa < 2:1254056/150‑1 (MQ=255) ccAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGa < 1:163241/150‑1 (MQ=255) aGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATa > 1:95329/1‑150 (MQ=255) aGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATa > 1:101558/1‑150 (MQ=255) ggACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGtt < 2:1346902/150‑1 (MQ=255) aGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGc < 1:853144/150‑1 (MQ=255) ggtggtTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCa < 1:1402029/150‑1 (MQ=255) ggtTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGt < 2:462502/150‑1 (MQ=255) cacaATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCgg < 1:152869/150‑1 (MQ=255) cacaATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCgg < 1:1428695/150‑1 (MQ=255) acaATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTGCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGt < 1:1275584/150‑1 (MQ=255) tACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACaaa < 1:301016/150‑1 (MQ=255) aCGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACaaaa < 2:137978/150‑1 (MQ=255) aCGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCAAGAAGCTGATAGGTTGGGCACGTTGCGGTACaaaa > 2:1548684/1‑150 (MQ=255) cGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAAt > 1:906290/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATc < 2:1645926/150‑1 (MQ=255) gCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATcc < 1:868610/150‑1 (MQ=255) cAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCg < 1:1628215/150‑1 (MQ=255) aaGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGc < 1:761420/150‑1 (MQ=255) gTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAg < 1:210594/150‑1 (MQ=255) gAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTg < 2:1659849/150‑1 (MQ=255) gAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTg > 1:958890/1‑150 (MQ=255) gCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAac > 2:1200676/1‑150 (MQ=255) gCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAac > 1:1524607/1‑150 (MQ=255) gCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAac < 1:875357/150‑1 (MQ=255) cAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAaca > 2:1406292/1‑150 (MQ=255) gATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAgg < 1:365556/150‑1 (MQ=255) gATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAgg > 2:116266/1‑150 (MQ=255) gATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAgg > 1:1532020/1‑150 (MQ=255) tCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGgcg > 2:127659/1‑150 (MQ=255) gaTGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGTGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCa < 2:745843/150‑1 (MQ=255) tGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAgg > 2:112105/1‑150 (MQ=255) tGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAgg > 1:283497/1‑150 (MQ=255) tGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAgg < 2:1328642/150‑1 (MQ=255) tttAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGc < 1:1616443/150‑1 (MQ=255) tttAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGc > 1:317613/1‑150 (MQ=255) tttAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGc < 2:1539732/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTc < 1:127659/150‑1 (MQ=255) cGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAg > 1:778413/1‑150 (MQ=255) tGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcg < 1:1406292/150‑1 (MQ=255) ttCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcgcc < 1:1188835/150‑2 (MQ=255) ttCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcg > 2:281238/1‑150 (MQ=255) cGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcg < 2:775373/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGt > 1:631519/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTg > 1:353379/1‑104 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTg < 2:353379/104‑1 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTc < 2:1508002/150‑1 (MQ=255) tCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGc < 2:497713/150‑1 (MQ=255) cACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAt > 2:90503/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtct > 1:32344/1‑150 (MQ=255) cTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtctc > 1:1191133/1‑150 (MQ=255) tGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATctct > 2:842924/1‑150 (MQ=255) gTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCtt > 2:667831/1‑150 (MQ=255) tttAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTc < 2:631519/150‑1 (MQ=255) tAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg > 2:1121985/1‑150 (MQ=255) tAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg > 1:366499/1‑150 (MQ=255) aaTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGt < 2:700021/150‑1 (MQ=255) aaTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGt < 1:1139570/150‑1 (MQ=255) aTCAGATAGATGTGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt < 2:1408207/150‑1 (MQ=255) aTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt > 1:1517381/1‑150 (MQ=255) agatagatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAt < 1:667831/150‑1 (MQ=255) agatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTggg < 1:1430980/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc > 2:1079899/1‑129 (MQ=255) cgcCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc < 1:1079899/129‑1 (MQ=255) | ATCACGCCCGATATCCAGCAAATTGTGATAGCGCACACCAGAAGGACAGGTGGTTTCACAATTACGGCAAGTGAGGCAGCGATCGAGATGCTCCTGTGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGG > NC_000913/3125160‑3125452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |