| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 478,752 | G→A | 6.2% | intergenic (‑135/+29) | pdeB ← / ← ylaC | c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeB/putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 478,752 | 0 | G | A | 6.2% | 358.8 / 8.2 | 113 | intergenic (‑135/+29) | pdeB/ylaC | c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeB/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (59/47); new base A (5/2); total (64/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GTCGTGTTCTCACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAG > NC_000913/478605‑478901 | gtTCTCACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGTCGCAGAGCTTTa < 1:1255989/150‑1 (MQ=255) gtTCTCACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTa > 1:116717/1‑150 (MQ=255) gtTCTCACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTa < 2:289663/150‑1 (MQ=255) ctcACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGc > 1:150285/1‑150 (MQ=255) tcACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGcc > 2:68157/1‑150 (MQ=255) cACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGTAAAGCTCTGCGCCt < 2:1324278/150‑1 (MQ=255) cACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCt > 1:618318/1‑150 (MQ=255) aCCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTg > 2:73806/1‑150 (MQ=255) aCCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTg < 1:1129214/150‑1 (MQ=255) aCCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTg < 2:706313/150‑1 (MQ=255) aGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTa > 2:829838/1‑150 (MQ=255) aGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAACGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTa > 2:851429/1‑150 (MQ=255) tatCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTa > 1:50546/1‑150 (MQ=255) tatCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTa > 1:1258705/1‑150 (MQ=255) ccTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAcc > 1:996083/1‑150 (MQ=255) ccTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAcc < 2:1191545/150‑1 (MQ=255) ccTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAcc > 1:720055/1‑150 (MQ=255) ccTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTAAGAATGGTATGTAAcc > 1:723288/1‑150 (MQ=255) ccTTATTAACACAGTGAAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAcc > 2:1460149/1‑150 (MQ=255) cTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGAATATCTTATTGTGGAAAAAGCCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGATGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAccc > 2:988785/1‑150 (MQ=255) ttattaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCt < 2:150285/150‑1 (MQ=255) tattaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGtcaaat < 2:411679/144‑6 (MQ=255) tattaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGtcaaat > 1:411679/1‑139 (MQ=255) tattaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTa > 1:728955/1‑150 (MQ=255) ttaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAAc > 2:1373107/1‑150 (MQ=255) ttaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAAc < 2:618318/150‑1 (MQ=255) acacAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTa < 1:108212/150‑1 (MQ=255) cacaGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGAT‑AGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAg > 2:264666/1‑150 (MQ=255) gtgtAGGGAAAGTATATCTGATTGTGTAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATg > 2:1028385/1‑150 (MQ=255) gtAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGtt < 1:42133/150‑1 (MQ=255) gtAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGtt > 2:1318128/1‑150 (MQ=255) tAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTg < 2:116717/150‑1 (MQ=255) aGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGa > 1:1251779/1‑150 (MQ=255) aGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGa < 1:829838/150‑1 (MQ=255) ggAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGAtt > 1:1498095/1‑150 (MQ=255) gAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTc > 1:829230/1‑150 (MQ=255) aaGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCgg > 2:1228205/1‑150 (MQ=255) atatCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGcgcg < 1:1324999/150‑1 (MQ=255) tCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCgcgagc > 2:302767/1‑150 (MQ=255) cTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGgcg < 1:1149098/144‑1 (MQ=255) cTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCgcgagcg > 2:9694/1‑150 (MQ=255) tGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCgcgagcga > 1:1031143/1‑150 (MQ=255) ttGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGTTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAggg < 2:960241/150‑1 (MQ=255) ttGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAggg < 1:1037884/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGTCGCGAGCGAGGGTaaaaa < 1:69546/150‑1 (MQ=255) aaaaGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAat < 1:1495820/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATc < 2:1258705/150‑1 (MQ=255) gctggctgGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGt > 2:1238584/1‑150 (MQ=255) ctagagaTAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTaaaaa > 1:1162485/4‑150 (MQ=255) ggAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGa > 2:1218157/1‑150 (MQ=255) taTAAGGAGGTAGAGCTGTTATTTTATGAAGTGATGGGTGGAAATGATCATTGTCATTTGACTAGGCGCAGAGCTTTAGGGGTGGTATGTAACGCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAagagag < 2:723288/149‑1 (MQ=255) gaTAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAg < 1:1028385/150‑1 (MQ=255) aTACGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGAGCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGt < 2:1643242/150‑1 (MQ=255) tAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGtt > 1:690721/1‑150 (MQ=255) tAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGtt > 1:937933/1‑150 (MQ=255) taggaggTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTc < 1:264666/149‑1 (MQ=255) aggaggTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCa > 1:855132/1‑150 (MQ=255) tAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCAcc < 1:387011/146‑1 (MQ=255) tAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCAcc > 2:387011/1‑146 (MQ=255) gagCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACg < 1:1370818/150‑1 (MQ=255) gCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGa < 2:825368/150‑1 (MQ=255) gTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGAt > 1:783920/1‑150 (MQ=255) aTTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTAACCTTTACGGACGATCa > 2:843842/1‑150 (MQ=255) cATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGGTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCAtttt > 2:1125363/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCAttttt < 2:288610/150‑1 (MQ=255) gAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTg < 2:1479979/150‑1 (MQ=255) gAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTg > 1:1034927/1‑150 (MQ=255) aaGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGc < 1:596008/150‑1 (MQ=255) aGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCa < 1:1373107/150‑1 (MQ=255) tGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAgt < 2:50546/150‑1 (MQ=255) gATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGGTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAgtt < 2:133400/150‑1 (MQ=255) tGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAgttgt > 1:735441/1‑150 (MQ=255) tGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAgttgt > 1:1552831/1‑150 (MQ=255) ggTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTc > 2:521369/1‑150 (MQ=255) gAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTa < 1:1238584/150‑1 (MQ=255) gAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTa < 2:728955/150‑1 (MQ=255) gAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTa > 2:652913/1‑150 (MQ=255) aaaCGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTAt < 1:654686/150‑1 (MQ=255) aaCGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATg < 2:1251779/150‑1 (MQ=255) aCGTTCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGa < 2:1649230/150‑1 (MQ=255) aCGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGa < 2:1162485/150‑1 (MQ=255) cGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGaa > 1:1532365/1‑150 (MQ=255) cGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGaa < 1:988785/150‑1 (MQ=255) aTTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATcc < 2:855132/150‑1 (MQ=255) ttGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTATCCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTACTTATGAACATCcg > 2:611437/1‑150 (MQ=255) tttGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGacac > 1:589225/1‑150 (MQ=255) tGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACAcgc > 1:1564908/1‑150 (MQ=255) taCCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACAcgcg > 1:100330/2‑150 (MQ=255) aCCAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGTATGTAACCATAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCgg > 2:1111937/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga > 2:617107/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga > 2:611228/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga > 2:769671/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga > 1:397745/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGgag < 1:668105/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGagag > 2:919160/1‑150 (MQ=255) gcgcAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAGCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGAGCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGt < 2:674366/150‑1 (MQ=255) gcAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTc > 1:914744/1‑150 (MQ=255) agagCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCaa < 2:937933/150‑1 (MQ=255) gagCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAg < 1:302767/150‑1 (MQ=255) gagCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAg < 1:1218157/150‑1 (MQ=255) | GTCGTGTTCTCACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAG > NC_000913/478605‑478901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |