Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,368,982 | G→C | 7.5% | intergenic (+28/+32) | yhcG → / ← yhcH | DUF1016 domain‑containing protein YhcG/DUF386 domain‑containing protein YhcH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,368,982 | 0 | G | C | 7.5% | 447.9 / 20.8 | 133 | intergenic (+28/+32) | yhcG/yhcH | DUF1016 domain‑containing protein YhcG/DUF386 domain‑containing protein YhcH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/52); new base C (6/4); total (77/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.33e-01 |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAG‑‑CGGTTTCGA‑ATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGT > NC_000913/3368837‑3369131 | tttGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAG‑‑CGGTTTCGA‑ATTCTGCAGACAGTGTc < 2:468907/150‑1 (MQ=255) tttGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAG‑‑CGGTTTCGA‑ATTCTGCAGACAGTGTc < 2:1242753/150‑1 (MQ=255) gCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAG‑‑CGGTTTCGA‑ATTCTGCAGACAGTGTCTGc < 2:868000/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |