Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | 212 (1.140) | 105/186 | 0.3 | 98.0% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293039 | 4 (0.020) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 4 (0.020) | 171 (0.920) | 93/186 | 0.9 | 97.5% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293130‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < NC_000913/1979270‑1979175 TTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGG < 1:1410919/100‑1 TTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT < 1:4403913/100‑1 TCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTG < 1:231612/100‑1 CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCA < 1:196230/100‑1 TGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAAC > 1:3342497/1‑100 TGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTG < 2:1065893/89‑1 TGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTG < 2:1572142/89‑1 GCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGA < 2:2727512/89‑1 GAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:4693059/100‑1 AATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCC < 2:2098315/89‑1 ATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:3981466/100‑1 ATCATCAGTTTAAATAGCGCTATATCCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGCTGATGCTGCCA < 2:2055824/89‑1 TCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:4544468/100‑1 ATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACT < 2:1304985/89‑1 TCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTT < 2:2017613/89‑1 CGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:4531359/100‑1 CGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:2904776/100‑1 GGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGTTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGTCGGCACAACGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:2795684/1‑89 GGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:4177361/1‑100 GGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:1537996/1‑89 GGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:1844825/1‑89 GGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:730535/89‑1 nTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACGGATTTAGTGTA > 1:530416/2‑100 TGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 2:2528339/89‑1 GTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGNCGGCACAAGGTGNTGCTGCCAACTTACTGA > 2:2385978/1‑89 AAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:47761/89‑1 AATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:3408311/100‑1 ATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:161029/1‑100 TAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:1386717/1‑89 TAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:1887074/1‑89 TAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:4650782/89‑1 AGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 2:971244/1‑89 GGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 2:2252994/1‑89 TATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:2816269/100‑1 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:1082608/100‑1 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:3502545/1‑100 ATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:4013595/100‑1 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:117963/1‑100 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:1943187/1‑89 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:498855/89‑1 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:3804390/89‑1 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:3976403/89‑1 GCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:844515/1‑100 GCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGGGTATGATGGT > 2:454267/1‑89 CCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTGAGTGTATGATGGTG > 2:1134433/1‑89 GCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 2:4634779/1‑89 GTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 1:820893/100‑1 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 1:2197297/1‑100 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:2428399/89‑1 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 2:1769064/1‑89 TTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 1:4288933/100‑1 TTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 2:3709898/89‑1 TTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:756150/1‑100 TTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:728805/89‑1 TTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:3165585/89‑1 TCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:3873797/1‑100 TCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 2:3537072/1‑89 TGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 2:3344638/89‑1 CTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 2:3604550/89‑1 CTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 2:3500427/89‑1 TTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:1745300/1‑100 TTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 2:4256311/89‑1 TTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:1499483/100‑1 ATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:1273358/1‑89 GAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:1474242/100‑1 AAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG > 2:1951033/1‑89 AAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG > 2:1487078/1‑89 AAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 1:1092704/1‑100 AAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:4156493/100‑1 AAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 1:1833478/1‑100 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:492299/100‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:2007058/100‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:394317/100‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:4329699/89‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:4496660/89‑1 TATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:4657448/100‑1 TATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:3466646/1‑100 TATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 2:3372105/89‑1 ATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT > 2:2322501/1‑89 TTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC < 2:4468272/89‑1 TTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 2:2249203/89‑1 TATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:3728546/89‑1 TTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 2:786801/1‑89 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 1:1356597/100‑1 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 1:395020/1‑100 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:4037271/1‑89 GCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:2986208/100‑1 GGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 1:2397465/100‑1 GGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC > 1:1348743/1‑100 CACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:2120067/1‑100 CACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:4550963/1‑100 CACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:1933401/1‑100 CACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 1:190829/100‑1 CACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 2:1863158/1‑89 ACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:4434296/100‑1 ACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 2:439949/89‑1 ACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 2:2462971/89‑1 ACAAGGTGATGCTGCCAACGTACTGGTTTAGTGTATGATGGTGTTTTAGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGGCCCGCC < 2:1853042/89‑1 AAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG < 2:617524/89‑1 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT < 2:1717678/89‑1 GTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293130‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < NC_000913/1979270‑1979175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |