| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 156229 = | 153 (1.350) | 8 (0.080) | 7/248 | NT | 5.7% | intergenic (‑28/+70) | yadV/yadN | putative fimbrial chaperone YadV/putative fimbrial protein YadN |
| ? | NC_000913 | 156267 = | 125 (1.220) | intergenic (‑66/+32) | yadV/yadN | putative fimbrial chaperone YadV/putative fimbrial protein YadN | |||||
TTAAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/156390‑156229‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattattccctgtATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTCGT > NC_000913/156267‑156415 TTAAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTAT < 2:1352473/150‑1TTAAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTAT > 1:833406/1‑150 TAAAGCGTCTTACGTTCGTGTCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATA < 1:623109/150‑1 TAAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATA > 2:711439/1‑150 AAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATAT < 1:1392571/150‑1 AAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATAT > 2:1715313/1‑150 GTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTC > 2:57803/1‑150 GTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTC < 2:486380/150‑1 GTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTC < 2:298763/150‑1 GTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTC > 2:636066/1‑150 CTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCC > 1:1822643/1‑150 CTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCC > 1:1282856/1‑150 TACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTG < 1:1560995/150‑1 ACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGT > 1:1248215/1‑150 CAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCC < 1:50132/127‑1 CAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCC > 2:50132/1‑127 CAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTG > 2:1112063/1‑150 GTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTT > 1:1631089/1‑150 AATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATT‑‑‑‑‑TTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCG > 2:248201/1‑150 TGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGAC < 1:1112063/150‑1 GAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCAC > 2:243582/1‑150 GAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCAC > 2:283771/1‑150 TACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACG < 1:283771/150‑1 CAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTA > 2:511913/1‑150 TCCCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTT < 2:736156/150‑1 CCTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGGACGAACGTAAGACTCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTG < 1:1128809/150‑1 CTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGT < 2:1918223/150‑1 CTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGT < 2:1631089/150‑1 CTGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATAC‑TACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTC < 1:1961924/150‑1 TGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTC < 2:1594071/150‑1 TGTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTC < 1:222203/150‑1 GTATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTCG < 1:243582/150‑1 TATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTCGT < 1:74448/150‑1 TTAAAGCGTCTTACGTTCGTGCCGTCGCAGACCAAACAGCAACTGCTGGTTATGTAAAAACTAACACTGCATACACCATTACTTATCAGTAAGTATTCACCAGTTAAATTGATTGAATGAATATACAGGGAATAATAATTTCTATTTTATATTATTCCCTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/156390‑156229‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattattccctgtATATTCATTCAATCAATTTAACTGGTGAATACTTACTGATAAGTAATGGTGTATGCAGTGTTAGTTTTTACATAACCAGCAGTTGCTGTTTGGTCTGCGACGGCACGAACGTAAGACGCTTTAAAATCATAAACAGCAGATTTTGTCGT > NC_000913/156267‑156415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |