New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1463445 | 225 (1.990) | 17 (0.160) | 9/260 | NT | 7.9% | intergenic (+7/‑94) | paaK/paaX | phenylacetate‑CoA ligase/DNA‑binding transcriptional repressor PaaX |
? | NC_000913 | = 1463482 | 181 (1.690) | intergenic (+44/‑57) | paaK/paaX | phenylacetate‑CoA ligase/DNA‑binding transcriptional repressor PaaX |
GTTGCCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1463290‑1463445 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtatcgACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCCCAC < NC_000913/1463482‑1463334 GTTGCCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGAC > 1:743048/1‑150 TTGCCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACG < 2:356198/150‑1 TTGCCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACG < 1:1504078/150‑1 GCCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTA > 1:990262/1‑150 CCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGAGCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTAT > 2:771701/1‑150 CAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATC < 1:939208/150‑1 CAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATC > 2:1468866/1‑150 CAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATC < 1:309324/150‑1 CAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACATATC > 2:166011/1‑150 CAGGTATACCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATC > 1:1807425/1‑150 AGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG < 1:732789/150‑1 AGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG > 1:1571474/1‑150 AGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG < 1:517739/150‑1 TAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGG > 1:1990645/1‑150 AAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGG < 2:1990645/150‑1 AGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGC < 2:438593/150‑1 GTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCC < 1:455352/150‑1 GTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCC < 1:1296288/150‑1 TCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGG < 1:1903517/150‑1 TCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGG < 1:1851600/150‑1 TCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCA < 1:1149576/150‑1 CGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGTCGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGC < 1:1558830/150‑1 CGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCACTTTACCCCACCAGGGC < 2:1366706/150‑1 GATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCC < 1:1748210/150‑1 GATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCC < 1:863071/150‑1 GATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGAGCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCC < 1:1862095/150‑1 TCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAG < 1:1596599/150‑1 TACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGG < 1:1269774/150‑1 ATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAG > 1:646905/1‑118 ATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑TCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAG < 2:646905/118‑1 GTATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATC < 1:589083/150‑1 TATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCTCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCC < 1:260561/150‑1 ATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCGCCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCC > 1:641413/1‑150 ATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCC < 1:320861/150‑1 ATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCC < 1:1472933/150‑1 ATCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCC < 2:988819/150‑1 TCGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCCC > 1:1642198/1‑150 CGACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCCCA > 2:1993490/1‑150 GACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCCCAC < 1:356972/150‑1 GACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCCCAC < 1:161844/150‑1 GTTGCCAGGTATGCCACCAGCTGCGCCATCGGATTAAGTCGATGGTGGGGATCTCTACCGATGTGATGATCGTTAACTGTGGCAGTATCCCGCGTTCAGAAGGCAAGGCGTGTCGGGTGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1463290‑1463445 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtatcgACTTCTGGCCCTGGCGCTTTACCCCACCAGGGCCAGACGATACGTCAGGCACCAACAATATTGCGCAGATCAAACACCCGACACGCCTTGCCTTCTGAACGCGGGATACTGCCACAGTTAACGATCATCACATCGGTAGAGATCCCCAC < NC_000913/1463482‑1463334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |