| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2728629 | NA (NA) | 4 (0.040) | 4/264 | NT | NA | noncoding (556/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA |
| ? | NC_000913 | = 2728650 | NA (NA) | noncoding (535/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA | |||||
ACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2728476‑2728629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagtGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGT < NC_000913/2728650‑2728502 ACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCTTTATACAAAAGGTACG < 2:27611/150‑1ACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACG < 2:1835493/150‑1ACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACG < 1:750526/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTTCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTAGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:841192/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:758564/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:1755492/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:259418/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:400427/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:492032/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 1:557980/1‑150 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:56966/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 2:1744181/1‑150 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:1513579/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:14131/150‑1 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 2:651681/1‑150 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 1:1327215/1‑150 CCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 1:1133370/1‑150 CTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCA > 1:158958/1‑150 CTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCA > 2:1423923/1‑150 CTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCA > 1:1753305/1‑150 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGTGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG < 1:1375337/150‑1 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG > 1:1028575/1‑150 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG > 1:802317/1‑150 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG < 1:952055/150‑1 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG < 1:994287/150‑1 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG < 2:1470698/150‑1 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG > 1:1752575/1‑150 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG > 1:1040192/1‑150 TTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTAAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAG < 2:1725308/150‑1 TCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGT < 2:1367771/150‑1 TCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGT > 2:13210/1‑150 TCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGT > 1:91591/1‑150 TCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGT < 1:904077/150‑1 CATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:271581/137‑1 CATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 2:271581/1‑137 GATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:1750605/129‑1 GATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 2:1750605/1‑129 CGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGATCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACC < 1:905211/150‑1 CTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC < 1:220952/111‑1 CTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGC > 2:220952/1‑111 CCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCTGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGT‑‑CA‑CACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGG < 1:1409172/150‑1 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACG > 2:1620859/1‑102 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACG < 1:1620859/102‑1 AACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCA > 2:1533338/1‑96 AACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCA < 1:1533338/96‑1 CCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGT < 1:1443052/122‑1 CCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATAAGTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGT > 2:1443052/1‑122 GCAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGACACC > 2:437052/1‑150 GCAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACC > 2:1734168/1‑150 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CAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCC < 2:25656/150‑1 CAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCC < 2:129207/150‑1 CAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCC > 2:1454577/1‑150 CAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCC > 2:672597/1‑150 CAGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACAGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACAAGAAACCC > 1:804155/1‑150 AGTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGTCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCG < 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GTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:1280545/150‑1 GTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:1206725/150‑1 GTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:1033755/150‑1 GTGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGAACCGAAACCCtg < 2:433031/150‑3 TGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGT < 1:566725/150‑1 TGGGAGCACGCTTAGGCGTGTGACTGCGTACCTTTTGTATAATGGGTCAGCGACTTATATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGT < 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NC_000913/2728650‑2728502 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |