| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4051966 | 205 (1.810) | 11 (0.100) | 9/266 | NT | 5.1% | intergenic (+110/‑79) | yihI/hemN | Der GTPase‑activating protein YihI/coproporphyrinogen III dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 4052012 | 208 (1.890) | intergenic (+156/‑33) | yihI/hemN | Der GTPase‑activating protein YihI/coproporphyrinogen III dehydrogenase | |||||
CGAGAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4051814‑4051966‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTCGCCGCGACAACCGCTGTAGTTTAACGAATAACCACACCAGATAACATATAACCGGAAGGGTTATCAGCAGAACGGGAAGGCCCACGGCGG < NC_000913/4052012‑4051864 CGAGAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTG > 2:1273394/1‑150CGAGAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTG > 1:1507444/1‑150 GAGAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGG < 1:1516465/150‑1 AGAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGC < 1:1906010/150‑1 GAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCT > 1:1820826/1‑150 AACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATGTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGCGGATGCCCGTTGCGGGGCATCAGCCGG < 2:675438/150‑1 AACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCC < 2:1663398/150‑1 ACGGATTGCCGCCGTGTGCCTTCCCTTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTTTTGTGGTTATTCGTTAAACTTCAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTTCGGCGTAGCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCG < 2:767110/150‑1 CGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTT < 2:1498710/150‑1 CCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGGTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCC < 2:1347686/150‑1 GGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTT < 2:1176056/150‑1 GGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCAGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTT < 2:1112210/150‑1 CCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTG < 1:1195318/150‑1 CCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCAACTTTTG < 1:36686/150‑1 gTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTC < 1:1836259/149‑1 TTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTC < 1:1843147/150‑1 GGCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTCGCCGCGACAACCGCTGTAGTTTAACGAATAACCACACCAGATAACATATAACCGGAAGGGTTATCAGCAGAACGGGAAGGCCCACGG < 1:1488668/150‑1 GCTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTCGCCGCGACAACCGCTGTAGTTTAACGAATAACCACACCAGATAACATATAACCGGAAGGGTTATCAGCAGAACGGGAAGGCCCACGGC < 1:522458/150‑1 CTACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTCGCCGCGACAACCGCTGTAGTTTAACGAATAACCACACCAGATAACATATAACCGGAAGGGTTATCAGCAGAACGGGAAGGCCCACGGCG > 2:22874/1‑150 TACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTCGCCGCGACAACCGCTGTAGTTTAACGAATAACCACACCAGATAACATATAACCGGAAGGGTTATCAGCAGAACGGGAAGGCCCACGGCGG < 1:1681757/150‑1 CGAGAAGCAAGAAGACATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4051814‑4051966‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctACGGCGTACCGGCGGATGCCCGTTTCGGGTCATCAGCCGGTTGCGCAGCCACTTTTGTCGCCGCGACAACCGCTGTAGTTTAACGAATAACCACACCAGATAACATATAACCGGAAGGGTTATCAGCAGAACGGGAAGGCCCACGGCGG < NC_000913/4052012‑4051864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |