| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4261350 = | 636 (5.620) | 35 (0.330) | 21/258 | NT | 5.7% | intergenic (+44/‑319) | yjbM/dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
| ? | NC_000913 | 4261368 = | 560 (5.260) | intergenic (+62/‑301) | yjbM/dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AGTGATGGAAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4261506‑4261350‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattgggtTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGC > NC_000913/4261368‑4261516 atTGATGTTAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTGTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTTTTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAAT < 2:938643/148‑1AGTGATGGAAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAAT < 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tcttAAATAATATTATTAGCCTTTAATTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTG < 2:1734882/146‑1 ATGTAAATAATCTTATTAGCCGTTAAATTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTAGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTG < 1:1262536/150‑1 ATGGAAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTG < 2:299121/150‑1 ATGGAAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTG < 2:87715/150‑1 ATGGAAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTG < 1:659869/150‑1 ATGGAAATAATCTTATTAGCCGTTAACTTTGTTAAGGCCAATGATAAACAATCCAGGTTCGACGATAAATAAAAAATCACACATTAAACTCTGGTGATATATCTCCCTGCTAATAGTATTGATAGAGAAAAAAGAACCCAATAAATATTG < 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2:740318/1‑150 GGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGA > 1:1835184/1‑150 GGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGA > 2:866293/1‑150 GTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTTTCGTGGAACATGGATTGTTTATAATTGGCCTTAACAAAGTTAACGCATAATAAGATTATTTCAATCACTTGGTGAGAG > 2:595140/1‑150 GTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAG > 1:277739/1‑150 GTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAG > 1:191487/1‑150 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |