| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4268317 = | NA (NA) | 24 (0.230) | 10/256 | NT | NA | intergenic (+10/+492) | tyrB/yjbS | tyrosine aminotransferase/uncharacterized protein YjbS |
| ? | NC_000913 | 4268341 = | NA (NA) | noncoding (24/24 nt) | other | REPt319 | |||||
AAGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4268474‑4268317‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccagcctgcAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTGG > NC_000913/4268341‑4268489 AAGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTC < 2:1083161/150‑1AAGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTC > 1:127338/1‑150AAGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTC < 2:1275997/150‑1AAGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTC > 2:1399355/1‑150 AGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATTAAGAAAGAGTGCAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCC > 2:464979/1‑150 AGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCC > 1:917851/1‑150 AGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCC > 2:1765760/1‑150 AGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCC > 1:1260095/1‑150 AGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTAATATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCC < 2:1938455/150‑1 GGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCA > 2:1346336/1‑150 GGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCA < 2:357255/150‑1 GGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCA > 1:241922/1‑150 GAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAG < 2:1649236/150‑1 GAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAG > 2:173095/1‑150 AATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACCATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGC < 2:1929029/150‑1 AATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGC < 2:1907726/150‑1 ATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCC < 1:1539683/150‑1 ATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCC < 2:1980814/150‑1 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2:567120/1‑150 CCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGC < 1:786964/150‑1 CCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGC < 2:59782/150‑1 CCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGC < 2:1800369/150‑1 ATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAATGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAA < 1:1026333/150‑1 AACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAG < 2:1299045/109‑1 AACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAG > 1:1299045/1‑109 AAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTGACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTT > 1:1591184/1‑150 GAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTA > 2:1285246/1‑150 CGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTT > 2:425099/1‑150 TTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATC > 2:1435832/1‑150 TCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTA > 1:1292513/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTGTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATat > 1:1590534/1‑148 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 2:1820456/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 1:1082249/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 2:142047/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 1:1330017/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 1:1476599/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 1:51014/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 1:1144075/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 2:381066/1‑150 CTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCT > 1:857793/1‑150 TGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTG > 1:98278/1‑150 TGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTG > 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1:1946752/150‑1 CAGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTT > 1:453035/1‑150 AGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTT < 1:964277/150‑1 AGCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTT > 2:12330/1‑150 GCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTT > 2:1706897/1‑150 GCCTGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGATTTAACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGATTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTT < 1:1537237/150‑1 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2:1961316/150‑1 TGCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTT < 1:1748509/150‑1 GCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACTTTTTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTTGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTG < 2:1855295/150‑1 GCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTG < 1:425099/150‑1 GCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTG < 1:438582/150‑1 GCAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTG < 1:285936/150‑1 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2:840709/1‑150 AAGGAATTCCAGATAATTGGGATAAGCTTAACAATAAAAGAACTAACAACGTTTATTATCTCTCACGTAGAACGATGGCATCAAAAAAATCATCTATAAAGAAAGAGTGAAAGCGACGACAGTTTAATTTCACTGCAGGCTGGGTAGCTCCAGCCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4268474‑4268317‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccagcctgcAGTGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTGG > NC_000913/4268341‑4268489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |