| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4326878 = | 404 (3.570) | 24 (0.230) | 11/256 | NT | 6.0% | intergenic (‑144/‑257) | yjdM/crfC | conserved protein YjdM/clamp‑binding sister replication fork colocalization protein |
| ? | NC_000913 | 4326902 = | 372 (3.520) | intergenic (‑168/‑233) | yjdM/crfC | conserved protein YjdM/clamp‑binding sister replication fork colocalization protein | |||||
TATTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4327035‑4326878‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctttttgcCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCTTG > NC_000913/4326902‑4327050 TATTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTT > 2:1582341/1‑150 ATTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTC > 1:825058/1‑150 ATTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTC < 2:704299/150‑1 ATTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATAATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTC > 2:561755/1‑150 TTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCT < 2:1661704/150‑1 TTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCT < 1:1589754/150‑1 TTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTT > 2:1577656/1‑150 AGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTT < 1:3253/150‑1 AGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTT < 2:63332/150‑1 AGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTT < 2:1024684/150‑1 GTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTT < 2:891903/150‑1 GTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTT < 1:747687/150‑1 GTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACG‑TTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG > 1:1505835/1‑150 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACTTTTAAAACGTCATAAAGATAAAAATATCATTTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATATAAGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG < 2:263982/150‑1 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAACCGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG < 1:1990702/150‑1 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAATAGATTATTTTCTTTTTG > 1:1852514/1‑150 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG > 1:497693/1‑150 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG < 1:656294/150‑1 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG < 2:1881740/150‑1 TGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTG > 2:28561/1‑150 GTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGC < 2:1145152/150‑1 GTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGC > 2:754617/1‑150 TACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGGCTATATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGGTCTAg > 2:1201825/1‑149 AAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTT > 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GGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACA > 1:634910/1‑150 GGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACA > 2:1161739/1‑150 GGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTAAAATGTTTTTTTTATATTTATGACGTTTTAAACTTATAAAAAGACGTTTTTTATTATGATAAAAAACAACA > 2:1784920/1‑150 GCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACAC > 1:377801/1‑150 CAAAAAGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTATGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACA > 2:1971361/1‑150 AGATTATTTTCTTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAA > 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TTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTAT < 1:127366/150‑1 TTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTAT < 2:1860086/150‑1 TTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTAT > 2:17920/1‑150 TTTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTAT > 2:1053582/1‑150 TTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACTTATCAGGAGAAGTTATTTATTATTATAAAAAACAAAAAACTAAATATAAAATTATT > 1:599069/1‑150 TTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATT < 1:1140284/150‑1 TTTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATT < 1:123796/150‑1 TTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTT < 1:36858/150‑1 TTTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTT < 1:1444940/150‑1 TTGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTC < 2:78288/150‑1 TGCCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCT > 2:426688/1‑150 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2:691363/1‑150 CCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCTTG > 2:420782/1‑150 TATTTAGTGTGTTGTTTTTTATCAGAATAAATAACGTCTTCTGATACGTTTAAAACGTCAGAAAGATAAAAATATCATGTGAATTAAAAAAAGAACAAGTAGAGCATTAACATTATCTTAAATAATAAATAGAGGCAAAAAGATTATTTTCTTTTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4327035‑4326878‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctttttgcCTCTATTTATTATTTAAGATAATGTTAATGCTCTACTTGTTCTTTTTTTAATTCACATGATATTTTTATCTTTCTGACGTTTTAAACGTATCAGAAGACGTTATTTATTCTGATAAAAAACAACACACTAAATATAAAATTATTTCTTG > NC_000913/4326902‑4327050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |