| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4477269 | 332 (2.940) | 21 (0.200) | 12/254 | NT | 6.5% | intergenic (+18/+38) | yjgL/argI | protein YjgL/ornithine carbamoyltransferase ArgI |
| ? | NC_000913 | = 4477280 | 293 (2.800) | intergenic (+29/+27) | yjgL/argI | protein YjgL/ornithine carbamoyltransferase ArgI | |||||
ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4477111‑4477269‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gatgccgggaAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACTCTCGA < NC_000913/4477280‑4477132 ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACTCTTTGGTTTGAATAATAGACCTATCACTTCATAAAATAATGTG < 2:898634/150‑1ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTG < 2:389104/150‑1ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTG > 2:200755/1‑150ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTG < 2:1011837/150‑1ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTG > 1:284978/1‑150 TGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGATCTATCACTGCATAAAATAATGTGA < 2:988827/150‑1 TGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGA < 2:1360848/150‑1 ATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATG > 1:965814/1‑150 ATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATG > 2:734692/1‑150 ATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATG > 2:1076798/1‑150 CAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCCCTGCATAAAATAATGTGATGCCG > 2:1638220/1‑150 AAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGG > 1:376740/1‑150 AAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGG > 1:723801/1‑150 ACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATTTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGCAAAATTTACTTATAGCAATACAACACTTTGGGTGTAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGA < 2:149791/150‑1 ATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCA > 1:1610425/1‑150 TTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAGTACAAACCATCCCGGCA < 1:347216/150‑1 TAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCAT < 1:1596765/150‑1 TAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCAT < 1:722259/150‑1 AATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATC < 2:1610425/150‑1 AATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATC < 1:1639510/150‑1 AATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATC < 1:537681/150‑1 AATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATC < 1:1981889/150‑1 ATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAAGCATCCCGGCATCA < 2:1415364/150‑1 ATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCA < 2:973898/150‑1 ATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCA < 1:1027283/150‑1 TATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACAT < 1:611513/150‑1 TATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACAT < 1:439450/150‑1 ATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATT < 1:825415/150‑1 ATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATT < 2:147471/150‑1 ATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATT < 1:1963500/150‑1 AACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAG < 1:890660/150‑1 AAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCAC < 1:165790/150‑1 AATCTACGTATACCAATAGAACACTTTGGGCGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGCTGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCT < 1:944905/150‑1 AACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTG < 2:1464631/150‑1 CCTATCCCTGCATAAAATAATGGGATGCCGGCAAAAACACACCATCCCGGCATCAAATTATTTTATGCAGTGATAGTTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGAAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGT < 2:442224/150‑1 GATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATT < 2:491802/150‑1 GATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATT > 1:939885/1‑150 GATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATT > 2:47960/1‑150 ATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTA < 1:1522428/150‑1 ATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTA < 2:727867/150‑1 ATGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTA < 1:683840/150‑1 TGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAA > 1:649305/1‑150 TGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAAT < 2:570627/143‑1 TGCCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAAT > 1:570627/1‑143 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT > 2:112816/1‑150 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT > 2:1754251/1‑150 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT < 1:934668/150‑1 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT > 2:1569845/1‑150 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT > 1:1723228/1‑150 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT < 1:1840763/150‑1 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT < 2:980842/150‑1 CCGGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTAGGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACT > 2:739284/1‑150 GGGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACTCT > 1:1724914/1‑150 GGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACTCTC < 1:1074932/150‑1 GGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACTCTC < 2:1015332/150‑1 GGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATA < 1:116168/131‑1 GGAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATA > 2:116168/1‑131 GAAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTGATACATTAACTCTCG > 2:1607647/1‑150 AAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACTCTCGA > 2:942382/1‑150 ATGATGCAAACTATCTTGCAATCGAGAGTTAATGTATTACCATATATTAATGAACAGCGTTTAAATAAACTAAATCCACCGGAAAATTTACGTATAGCAATAGAACACTTTGGGTGGAAGAATAGACCTATCACTGCATAAAATAATGTGATGCCGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4477111‑4477269‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gatgccgggaAATACAAACCATCCCGGCATCACATTATTTTATGCAGTGATAGGTCTATTCTTCCACCCAAAGTGTTCTATTGCTATACGTAAATTTTCCGGTGGATTTAGTTTATTTAAACGCTGTTCATTAATATATGGTAATACATTAACTCTCGA < NC_000913/4477280‑4477132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |