| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 429734 | 66 (0.630) | coding (230/972 nt) | secF | Sec translocon accessory complex subunit SecF | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCAGGTTCTGAA > NC_000913/429554‑429851 | aTGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATAGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGA‑AAAACCGGCTg > 2:328875/1‑150 (MQ=255) tGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGA‑AAAACCGGCTGa > 1:913643/1‑150 (MQ=255) ttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGA‑AAAACCGGCTGAAATTg < 2:1142797/150‑1 (MQ=255) 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cTCGA‑AAAACCGTCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAagccggttttgtagagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacag > 2:344429‑M2/1‑47 (MQ=255) cTCGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagc < 1:804064‑M2/150‑104 (MQ=255) cTCGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagccaccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagc < 2:1146578‑M2/150‑104 (MQ=255) cTCGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGc < 1:1290405/150‑1 (MQ=255) cGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg < 1:1165546/150‑1 (MQ=255) cGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCACACATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGAGAAACAGGAGGTCAGGTTTTGGGCAg > 2:1735463/1‑150 (MQ=255) gA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGc > 1:68643/1‑150 (MQ=255) a‑aaaaCCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGcc < 2:1300766/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCa > 1:119873/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGCTttttgcaatgcatcacgcattacgtcaatttcagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagcagacca > 1:758646‑M1/1‑9 (MQ=255) aaaCCGGCTttttgcaatgcatcacgcattacgtcaatttcagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagcagacca > 1:1690462‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCCGGCTttttgcaatgcatcacgcattacgtcaatttcagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagcagaccag < 1:128950‑M1/150‑143 (MQ=255) aaCCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagcagaccag < 1:961628‑M2/150‑111 (MQ=255) aaCCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCAgg < 2:482291/150‑1 (MQ=255) ccGGCTttttgcaatgcatcacgcattacgtcaatttcagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagcagaccagag < 1:1860326‑M1/150‑145 (MQ=255) gCTttttgcaatgcatcacgcattacgtcaatttcagccggtttttcgagcgtaatttcaataaccgtaccaccggtgaaatccagcccccagttaaagccgcgcacgcccataataacgatagcagcgattaacagcagaccagagatg > 1:644889‑M1/1‑3 (MQ=255) tGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCAGGTTCTGaa < 1:1965275/150‑1 (MQ=255) | ATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGA‑AAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCAGGTTCTGAA > NC_000913/429554‑429851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |