| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1054170 | 68 (0.600) | 4 (0.040) | 4/256 | NT | 5.7% | coding (2009/2745 nt) | torS | sensory histidine kinase TorS |
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TCTCTAAAGCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCGTAAACAAAAACAGCTTCCAACCTCCGGCGTGCTGGTGGCGCTCAGTTCGCCGCCCATCGCCTGGGCCAGACGGCTACTGATAGTCAGTCCCAGCCCGGTGCCGCCGCGTTTGCCG > NC_000913/1054021‑1054319 | tctcTAAAGCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTG < 1:1553029‑M1/150‑1 (MQ=255) ctctAAAGCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTgg < 1:1688102/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACg > 2:259790/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACg > 2:267080/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGt < 2:558119/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGc < 1:1774484/150‑1 (MQ=255) ggCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGc < 1:1767267/150‑1 (MQ=255) gCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCa < 2:1246259/150‑1 (MQ=255) attgaaaaCAGCAAAAATCTGCGAAACAATGGTTTTCAGCATCTAAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCTGGTTATATTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAac > 2:1581638/7‑150 (MQ=255) gCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACg > 2:978535/1‑150 (MQ=255) cAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTa > 2:834537/1‑150 (MQ=255) cAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACg > 2:956783/1‑150 (MQ=255) gCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTCCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGc > 2:439087/1‑150 (MQ=255) ccaacaaTCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGc < 2:984851/149‑1 (MQ=255) caacaaTCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCa > 2:991442/1‑150 (MQ=255) acaaTCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGTACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAg < 2:138732/150‑1 (MQ=255) aaTCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCg < 1:206295/150‑1 (MQ=255) aaTCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCg > 2:66718/1‑150 (MQ=255) 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tGTTTTTGtttacgcttgccgttacgtgttgccacggcacccgtgccaaaaacagtcaatcaggcggtgcgtcttgacggtttacgtttgctgttaattgaagataacccgctaacccagcgaattaccattgagatgctgaaaaccagt < 2:343157‑M1/150‑143 (MQ=255) gTTTTTGtttacgcttgccgttacgtgttgccacggcacccgtgccaaaaacagtcaatcaggcggtgcgtcttgacggtttacgtttgctgttaattgaagataacccgctaacccagcgaattaccattgagatgctgaaaaccagtg > 1:210445‑M1/1‑7 (MQ=255) gTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCGTAAACAAAAACAGCTTCCAACCTCCGGCGTGCTGGTGGCGCTCAGTTCGCCGCCCATCGCCTGGGCCAGACGGCTACTGAt > 1:1988722/1‑122 (MQ=255) gTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCGTAAACAAAAACAGCTTCCAACCTCCGGCGTGCTGGTGGCGCTCAGTTCGCCGCCCATCGCCTGGGCCAGACGGCTACTGAt < 2:1988722/122‑1 (MQ=255) tttttGtttacgcttgccgttacgtgttgccacggcacccgtgccaaaaacagtcaatcaggcggtgcgtcttgacggtttacgtttgctgttaattgaagataacccgctaacccagcgaattaccattgagatgctgaaaaccagtgg < 1:1805149‑M1/150‑145 (MQ=255) ttttGtttacgcttgccgttacgtgttgccacggcacccgtgccaaaaacagtcaatcaggcggtgcgtcttgacggtttacgtttgctgttaattgaagataacccgctaacccagcgaattaccattgagatgctgaaaaccagtggt > 1:1107460‑M1/1‑5 (MQ=255) tttGtttacgcttgccgttacgtgttgccacggcacccgcgccaaaaacagtcaatcaggcggtgcgtcttgacggtttacgtttgctgttaattgaagataacccgctaacccagcgaattaccattgagatgctgaaaaccagtggtg < 1:1219749‑M1/150‑147 (MQ=255) gtttacgcttgccgttacgtgttgccacggcacccgtgccaaaaacagtcaatcaggcggtgcgtcttgacggtttacgtttgctgttaattgaagataacccgctaacccagcgaattaccattgagatgctgaaaaccagtggtgcgc > 1:1447000‑M1/1‑1 (MQ=255) ggCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCGTAAACAAAAACAGCTTCCAACCTCCGGCGTGTTGGTGGCGCTCAGTTCGCCGCCCATCGCCTGGGCCAGACGGCTACTGATAGTCAGTCCCAGCCCGGTGCCGCCGCGTTTg < 2:428409/147‑1 (MQ=255) ggCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCGTAAACAAAAACAGCTTCCAACCTCCGGCGTGTTGGTGGCGCTCAGTTCGCCGCCCATCGCCTGGGCCAGACGGCTACTGATAGTCAGTCCCAGCCCGGTGCCGCCGCGTTTg > 1:428409/1‑147 (MQ=255) | TCTCTAAAGCCTGCGCGGCATTGCCAACAGCAACAATCTGCGCACCACTGGTTTTCAGCATCTCAATGGTAATTCGCTGGGTTAGCGGGTTATCTTCAATTAACAGCAAACGTAAACCGTCAAGACGCACCGCCTGATTGACTGTTTTTGGCACGGGTGCCGTGGCAACACGTAACGGCAAGCGTAAACAAAAACAGCTTCCAACCTCCGGCGTGCTGGTGGCGCTCAGTTCGCCGCCCATCGCCTGGGCCAGACGGCTACTGATAGTCAGTCCCAGCCCGGTGCCGCCGCGTTTGCCG > NC_000913/1054021‑1054319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |