New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 1067972 | 75 (0.700) | intergenic (‑264/‑109) | wrbA/ymdF | NAD(P)H:quinone oxidoreductase/conserved protein YmdF |
AACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCGGCAATTTTGCAG > NC_000913/1067819‑1068117 | aacaacTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGG < 2:213223‑M1/150‑1 (MQ=255) aacaacTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGG < 2:661610‑M1/150‑1 (MQ=255) aacaacTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGG < 1:1422458‑M1/150‑1 (MQ=255) caacTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTc > 1:231198/1‑150 (MQ=255) cTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGc < 1:1035833‑M2/150‑2 (MQ=255) tCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGcccg > 2:147930‑M2/1‑146 (MQ=255) tCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGcccg > 2:669705‑M2/1‑146 (MQ=255) acaAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGcccgcg > 1:1494933‑M2/1‑144 (MQ=255) aaGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTc < 2:1411434/150‑1 (MQ=255) aaGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTc < 1:580568/150‑1 (MQ=255) cACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGcagacccgcgtttgg < 2:1471987‑M1/150‑16 (MQ=255) aCGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGtt < 1:1660187/150‑1 (MQ=255) cGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTc < 1:189119/150‑1 (MQ=255) tAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCAc < 2:1864155/150‑1 (MQ=255) gTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCtt < 1:1264677/150‑1 (MQ=255) gTCGCAAAATGACACATTTTTATCTAATCGCGATTTTTTAATAATAAGACCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATATATTCTCGCTAAGAAGATGTTGCAGGATATTAACAAAATCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCta > 2:1618531/1‑149 (MQ=255) aaaaTGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTcc < 1:1556580/150‑1 (MQ=255) aaaaTGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTcc < 2:1035833/150‑1 (MQ=255) 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ttACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTcc < 1:1784194/150‑1 (MQ=255) ttACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTcc < 1:934027/150‑1 (MQ=255) ttACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTcc > 2:1121680/1‑150 (MQ=255) ttACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTcc > 1:1136402/1‑150 (MQ=255) tACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCg < 2:197309/150‑1 (MQ=255) ccAAACGCGGGTCTGcccgcgtttggtaatatcctgcaacagcttcttagcgagaatagatatcatctccaataattatccataagccgctcttatgattaaaaaaacgcgatgagataaaaatgtgtcattttgcgacaaaattacgtg < 2:1471987‑M2/150‑136 (MQ=255) ccAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCGGc > 1:84677/1‑150 (MQ=255) cAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCGGCa < 1:1336850/150‑1 (MQ=255) cgcgGGcagacccgcgtttggtaatatcctgcaacagcttcttagcgagaatagatatcatctccaataattatccataagccgctcttatgattaaaaaaacgcgatgagataaaaatgtgtcattttgcgacaaaattacgtgcttgt > 1:1494933‑M1/1‑6 (MQ=255) cgGGcagacccgcgtttggtaatatcctgcaacagcttcttagcgagaatagatatcatctccaataattatccataagccgctcttatgattaaaaaaacgcgatgagataaaaatgtgtcattttgcgacaaaattacgtgcttgtga > 2:669705‑M1/1‑4 (MQ=255) cgGGcagacccgcgtttggtaatatcctgcaacagcttcttagcgagaatagatatcatctccaataattatccataagccgctcttatgattaaaaaaacgcgatgagataaaaatgtgtcattttgcgacaaaattacgtgcttgtga > 2:147930‑M1/1‑4 (MQ=255) cgGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCGGCAATTTTg < 1:1047759/150‑1 (MQ=255) gggTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCGGCAATTTTGc < 1:1595058/150‑1 (MQ=255) gcagacccgcgtttggtaatatcctgcaacagcttcttagcgagaatagatatcatctccaataattatccataagccgctcttatgattaaaaaaacgcgatgagataaaaatgtgtcattttgcgacaaaattacgtgcttgtgaaag < 1:1035833‑M1/150‑150 (MQ=255) | AACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCAATATGATGTCTATACCCAGACGGAGGTCAGTAATGGCAAACCATCGAGGCGGTTCCGGCAATTTTGCAG > NC_000913/1067819‑1068117 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |