| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2405637 | 83 (0.730) | 6 (0.060) | 6/252 | NT | 7.1% | intergenic (‑565/+66) | nuoA/lrhA | NADH:quinone oxidoreductase subunit A/DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA |
| ? | NC_000913 | = 2405647 | 81 (0.780) | intergenic (‑575/+56) | nuoA/lrhA | NADH:quinone oxidoreductase subunit A/DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TATTTTTTAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCACGGATTATGGTAGCT > NC_000913/2405490‑2405786 | tATTTTTTAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGtt < 1:921269/150‑1 (MQ=255)tATTTTTTAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGtt > 1:1604916/1‑150 (MQ=255)tATTTTTTAACATCAATGTATCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTTTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGtt > 2:1580287/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGttt < 1:711635/150‑1 (MQ=255) ttttAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTaaa < 1:1588886/150‑1 (MQ=255) tttAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTaaa > 1:18873/1‑150 (MQ=255) tttAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTaaaa < 2:627334/150‑1 (MQ=255) tttAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTaaaa > 1:170588/1‑150 (MQ=255) tttAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTaaaa < 1:1571682/150‑1 (MQ=255) catcatTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTAAAACACcc > 2:221863‑M2/1‑148 (MQ=255) atcatTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTAAAACACccc < 1:1148154‑M2/150‑4 (MQ=255) tcatTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTAAAACACcccc < 1:1099099‑M2/150‑5 (MQ=255) tcatTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAA‑AAGCCGCTGGGGTTTAAAACACcccc > 2:1341112‑M2/1‑146 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |