New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3426817 = | 84 (0.740) | 9 (0.080) | 9/270 | NT | 11.9% | intergenic (‑34/+141) | rrlD/alaU | 23S ribosomal RNA/tRNA‑Ala |
? | NC_000913 | = 3943701 | 51 (0.460) | intergenic (+191/‑3) | gltU/rrlC | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA |
GGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC > NC_000913/3426668‑3426966 | aaactcatcttcgggtgatgtttgagatatttgctctttaaaaatctggatcaagctgaaaattgaaacactgaacaacgaaagttgttcgtgagtctctcaaattttcgcaacacgatgatgaatcgaaagaaacatcttcgggttgtg > 2:1129449‑M1/150‑150 (MQ=255) aaactcatcttcgggtgatgtttgagatatttgctctttaaaaatctggatcaagctgaaaattgaaacactgaacaacgaaagttgttcgtgagtctctcaaattttcgcaacacgatgatgaatcgaaagaaacatcttcgggttgtg > 1:437488‑M1/150‑150 (MQ=255) cGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTc < 1:21942/150‑1 (MQ=32) cGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTc < 2:1016654/150‑1 (MQ=32) cGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTc < 1:1416344/150‑1 (MQ=32) aCGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAg < 2:881123/150‑1 (MQ=32) cGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAgt > 1:1826351/1‑150 (MQ=32) cTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAgtgt < 1:1821463/150‑1 (MQ=32) tATCGCAGATTGGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTGACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCAGGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGttt < 2:27728/150‑1 (MQ=12) tATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGttt < 2:966498/150‑1 (MQ=32) tATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGttt < 2:959297/150‑1 (MQ=32) aTCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTc > 1:1523642/1‑150 (MQ=32) aTCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTc > 2:1068381/1‑150 (MQ=32) cGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCaa > 1:86166/1‑150 (MQ=32) ttAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCa > 2:305123/1‑150 (MQ=32) ttAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCa > 2:1635681/1‑150 (MQ=32) tAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCa < 2:1299470/149‑1 (MQ=32) tAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCa > 1:1299470/1‑149 (MQ=32) 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cccGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTAtttttt < 1:390177/150‑1 (MQ=255) ccGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTttta < 2:23874/150‑1 (MQ=255) ccGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTttta > 1:1747641/1‑150 (MQ=255) aatcgaaagaaacatcttcgggttgtGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTCTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTaaa > 2:1251069‑M1/27‑99 (MQ=255) aatcgaaagaaacatcttcgggttgtGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTCTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTaaa < 1:1251069‑M1/73‑1 (MQ=255) cGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttat < 1:1783119/150‑1 (MQ=255) tcgaaagaaacatcttcgggttgcGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttatt > 2:1106536‑M1/25‑150 (MQ=255) gAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttatt < 1:396061/150‑1 (MQ=255) gAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttatt < 1:78320/150‑1 (MQ=255) gATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTaa < 2:344153/150‑1 (MQ=255) aaagaaacatcttcgggttgcGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTaa > 1:1661814‑M1/22‑150 (MQ=255) tttCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCAc < 1:1489482/150‑1 (MQ=39) ttCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTaa > 2:1836578/1‑145 (MQ=38) ttCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTaa < 1:1836578/145‑1 (MQ=38) ttCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCAATACata > 1:1940143/1‑148 (MQ=21) cAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAgaga < 1:873423/150‑1 (MQ=32) GAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCGAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGc > 2:1465676‑M1/1‑150 (MQ=255) GAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGc > 1:1998592‑M1/1‑150 (MQ=255) GAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGc < 1:1972155‑M1/150‑1 (MQ=255) GAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGc < 2:1537687‑M1/150‑1 (MQ=255) | GGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC > NC_000913/3426668‑3426966 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |