New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3690117 = | 262 (2.320) | 15 (0.140) | 11/260 | NT | 5.6% | coding (145/1107 nt) | bcsZ | endo‑1,4‑D‑glucanase |
? | NC_000913 | 3690143 = | 257 (2.400) | coding (119/1107 nt) | bcsZ | endo‑1,4‑D‑glucanase |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
CCACAGCCAGGCGGGCAAACGTTCTTTTAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAACACATTCATCTTCA > NC_000913/3689968‑3690266 | cgtcttaacccggataacgagtaattgaagatgaatgtgttgcgtagtggaatcgtgacgatgctgctgctggctgcctttagtgttcaggcagcctgtacctggcctgcctgggagcagtttaaaaaggattacatcagtcaggaaggg < 1:1919940‑M1/1‑1 (MQ=255) tcttaacccggataacgagtaattgaagatgaatgtgttgcgtagtggaatcgtgacgatgctgctgctggctgcctttagtgttcaggcagcctgtacctggcctgcctgggagcagtttaaaaaggattacatcagtcaggaagggcg > 2:124558‑M1/148‑150 (MQ=255) cttaacccggataacgagtaattgaagatgaatgtgttgcgtagtggaatcgtgacgatgctgctgctggctgcctttagtgttcaggcagcctgtacctggcctgcctgggagcagtttaaaaaggattacatcagtcaggaagggcgc < 2:1896661‑M1/4‑1 (MQ=255) cttaacccggataacgagtaattgaagatgaatgtgttgcgtagtggaatcgtgacgatgctgctgctggctgcctttagtgttcaggcagcctgtacctggcctgcctgggagcagtttaaaaaggattacatcagtcaggaagggcgc < 2:726009‑M1/4‑1 (MQ=255) cGGGCAAACGTTCTTTTAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTgcg < 1:205861/139‑1 (MQ=255) aaaCGTTCTTTTAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCg < 1:634699/150‑1 (MQ=255) aaCGTTCTTTTAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGa < 1:1563231/150‑1 (MQ=255) tCTTTTAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGAcg < 2:449394/150‑1 (MQ=255) ttttAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGAcgcg > 2:674768/1‑150 (MQ=255) ttAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGcc < 1:1971181/150‑1 (MQ=255) gaagatgaatgtgttgcgtagtggaatcgtgacgttgctgctgctggctgcctttagtgttcaggcagcctgtacctggcctgcctgggagcattttaaataggtttacatcagtcaggaaggGCGCGTCGCTGGTGTGGATGACGCGcc > 2:589301‑M1/124‑150 (MQ=255) aaGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCtt > 2:1570457/1‑150 (MQ=255) atgaatgtgttgcgtagtggaatcgtgacgatgctgctgctggctgcctttagtgttcaggcagcctgtacctggcctgcctgggagcagtttaaaaaggattacatcagtcaggaaggGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTc > 1:1701382‑M1/120‑150 (MQ=255) 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ttGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATcc < 1:1328939/150‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCttt > 2:200024/1‑150 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCttt < 2:1881546/150‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCttt > 2:1190698/1‑150 (MQ=255) tCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCtttt > 1:217863/1‑150 (MQ=255) 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tGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAgcagcagca < 1:1896403/150‑1 (MQ=255) tAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTc > 2:1659999/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCa < 2:251471/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACg < 1:524558/150‑1 (MQ=255) tttGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGa > 2:1125401/1‑150 (MQ=255) gCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCCTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTc > 1:1823671/1‑150 (MQ=255) cccTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTcc > 2:855492/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCa < 1:1772813/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTAc < 1:1570457/150‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACg > 1:1344740/1‑150 (MQ=255) ggAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACg < 2:1344740/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGc < 1:290623/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGc < 1:921795/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGc < 2:1112422/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGTGATTTTGCGCGCGGCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGc < 1:164131/150‑1 (MQ=255) tggtgATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAaca < 1:674768/150‑1 (MQ=255) tggtgATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAaca > 2:1638579/1‑150 (MQ=255) tgATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAACACAt < 2:1208372/150‑1 (MQ=255) tttGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCCCTACGCAACACATTccg > 1:1202771/1‑148 (MQ=255) tttGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAACACATTCAt < 1:1276092/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAACACATTCATc > 1:1002884/1‑150 (MQ=255) GCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAACACATTCATCTTCa > 1:444473‑M1/1‑150 (MQ=255) | CCACAGCCAGGCGGGCAAACGTTCTTTTAAAGAACCCTGAGCGAGATTGTTCTGCGTCCAGTCGAGAATATTATCGAAAGCTGCACGGTCGTTAGCCGCCAGGGCAGAGAACATGCCGTAACTTTGCCCTTCGGAGGTGGTGATTTTGCGCGCGTCGCTGGGGTCGATGACGCGCCCTTCCTGACTGATGTAATCCTTTTTAAACTGCTCCCAGGCAGGCCAGGTACAGGCTGCCTGAACACTAAAGGCAGCCAGCAGCAGCATCGTCACGATTCCACTACGCAACACATTCATCTTCA > NC_000913/3689968‑3690266 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |