| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 734664 = | 55 (0.490) | 5 (0.050) | 5/262 | NT | 7.5% | pseudogene (445/1434 nt) | ybfO | conserved protein, rhs‑like YbfO |
| ? | NC_000913 | 734704 = | 70 (0.650) | pseudogene (485/1434 nt) | ybfO | conserved protein, rhs‑like YbfO | |||||
GACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGCAAAACCAGATG > NC_000913/734555‑734852 | gACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGa > 1:1637996/1‑150 (MQ=32) agccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagccggtcgagcatctgcaccagcaccggcgggaacaccacactgccaccgtcttCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGa > 1:1057292‑M1/107‑150 (MQ=255) gccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagccggtcgagcatctgcaccagcaccggcgggaacaccacactgccaccgtcttCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGAc > 2:505097‑M1/106‑150 (MQ=255) gATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACgg > 1:16607/1‑150 (MQ=32) aTACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGt > 2:1179841/1‑150 (MQ=32) aGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCa > 2:807098/1‑150 (MQ=32) gAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAg > 2:26648/1‑150 (MQ=32) gAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAg > 2:860255/1‑150 (MQ=32) gAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAg > 2:1461192/1‑150 (MQ=32) aCGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAgtg > 2:65672/1‑150 (MQ=32) gAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTAAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGgtgt > 2:1070135/1‑150 (MQ=17) cccGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTcc < 1:1230656/150‑1 (MQ=32) cccGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTcc > 2:897837/1‑150 (MQ=32) cccGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTcc > 1:675456/1‑150 (MQ=32) gCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgc > 2:1005598/1‑150 (MQ=32) tCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCgg < 1:247212/150‑1 (MQ=32) gACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCt > 1:1211455/1‑150 (MQ=32) tttATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGc > 2:127895/1‑150 (MQ=32) 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aCGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGaa < 2:979353/150‑1 (MQ=32) cGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGaaa > 1:935292/1‑150 (MQ=32) gCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAg < 2:1632272/150‑1 (MQ=32) gCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAg < 2:271778/150‑1 (MQ=32) cACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTg < 2:425769/150‑1 (MQ=32) catcaGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAAt > 2:106755/1‑150 (MQ=32) tcaGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATcc < 1:1179841/150‑1 (MQ=32) caGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGaa < 1:1248892/139‑1 (MQ=32) caGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGaa > 2:1248892/1‑139 (MQ=32) aGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTg < 1:887940/150‑1 (MQ=32) 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2:16607/150‑1 (MQ=32) cccTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTgg > 1:19295/1‑150 (MQ=32) cccTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCCGACGGTgg > 1:10079/1‑150 (MQ=17) ccTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGa > 2:1680550/1‑150 (MQ=32) ttCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGc < 1:714330/150‑1 (MQ=32) agcagTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGa < 2:1637996/150‑1 (MQ=32) agcagTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGa < 1:1814930/150‑1 (MQ=32) agTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGc < 2:1104506/150‑1 (MQ=32) agTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGc < 2:675456/150‑1 (MQ=32) gTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGCa < 2:1211455/150‑1 (MQ=32) gTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGCa < 2:139646/150‑1 (MQ=32) tCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGCaa < 1:106755/150‑1 (MQ=32) cgAAGACGGTTGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGGGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGCAAAACCAGAt < 1:1797060‑M2/148‑1 (MQ=255) gAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGATGGTGGAGCAGATGCAAAACCAGATg < 1:807098‑M2/149‑1 (MQ=255) | GACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGAGCAGATGCAAAACCAGATG > NC_000913/734555‑734852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |