| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 871938 | 78 (0.690) | 4 (0.040) | 4/258 | NT | 5.1% | coding (49/912 nt) | gsiD | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiD |
| ? | NC_000913 | = 871966 | 74 (0.700) | coding (77/912 nt) | gsiD | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiD | |||||
TATTCTTATCAACTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTCGTTATTTTATTGATTGTGGTGGCCATTTTTGCACGCTGGATCGCTCCCTATGACGCCGAAAATTATTTTGATTATGACAATCTGAAT > NC_000913/871821‑872114 | tATTCTTATCAACTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCgtgg < 2:1475649‑M2/150‑5 (MQ=255) ttCTTATCAACTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCgtggca < 1:1334796‑M2/150‑7 (MQ=255) ttATCAACTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGa > 1:761880/1‑150 (MQ=255) atcatcTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAAt < 1:717667/150‑1 (MQ=255) aTCAACTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGAGACTATTTAAATGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGACACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACAACGTGGCATGAAt > 1:6053/1‑150 (MQ=255) tCAACTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAAtt < 2:1219661/150‑1 (MQ=255) cTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTgg < 2:1334796/150‑1 (MQ=255) cTTAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTgg > 2:314759/1‑150 (MQ=255) tAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGcg > 2:1263797/1‑150 (MQ=255) tAGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGcg < 2:14110/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGGATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGcga > 2:179757/1‑150 (MQ=255) ggtggATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTTGCATGAATTCTGGcgacga > 2:273831/1‑150 (MQ=255) tggATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGAtt > 1:1397587/1‑150 (MQ=255) ggATGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGAttt < 2:1360114/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCg < 2:415269/150‑1 (MQ=255) tgtgCTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGc > 2:358921/1‑150 (MQ=255) cTTTACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTc < 1:719619/150‑1 (MQ=255) tttACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCa < 1:1673381/150‑1 (MQ=255) tACGCCGCCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGc < 1:1475649/150‑1 (MQ=255) cgccgcCATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCat > 1:593453/1‑150 (MQ=255) ccgccATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCatat > 2:114953/1‑150 (MQ=255) gccATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGACGGCGAAATCGTCGCCAGAattcat < 1:1257128/150‑5 (MQ=255) ccATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGc < 2:972582/150‑1 (MQ=255) cATTAACCCGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTTGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCg < 1:273831/150‑1 (MQ=255) cccGGCTATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGAcc > 2:1879777/1‑150 (MQ=255) tATCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCa < 2:593453/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCat < 2:1405089/150‑1 (MQ=255) cAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCatta > 1:919453/1‑150 (MQ=255) cAGGTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCatta > 2:1599794/1‑150 (MQ=255) ggTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCattatt > 2:1405695/1‑150 (MQ=255) ggTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATCCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCattatt > 1:1937244/1‑150 (MQ=255) gTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTc < 2:534428/150‑1 (MQ=255) gTACAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTc < 1:114953/150‑1 (MQ=255) aCAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTCGt < 2:61564/150‑1 (MQ=255) cAAGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTCGtt > 2:1060509/1‑150 (MQ=255) aaGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTCGtta < 1:687085/150‑1 (MQ=255) aGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGCCCGCCGCATTATTCGttat > 1:840154/1‑150 (MQ=255) aGTAAGGATGCGACTATTTAACTGGCGACGTCAGGCGGTGTTAAACGCCATGCCACTGGTCAAACCTGACCAGGTACGTACACCGTGGCATGAATTCTGGCGACGATTTCGCCGTCAGCATATGGCGATGACCGCCGCATTATTCGttat > 2:214942/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |