New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1486996 | 91 (0.800) | 5 (0.050) | 5/252 | NT | 5.4% | intergenic (+33/‑239) | hrpA/ydcF | ATP‑dependent RNA helicase HrpA/DUF218 domain‑containing protein YdcF |
? | NC_000913 | = 1487009 | 93 (0.890) | intergenic (+46/‑226) | hrpA/ydcF | ATP‑dependent RNA helicase HrpA/DUF218 domain‑containing protein YdcF |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGATAGAAGAGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACG > NC_000913/1486860‑1487158 | tgatAGAAGAGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAgcg > 1:902228/1‑150 (MQ=255) gATAGAAGAGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGc < 2:1499696‑M2/150‑2 (MQ=255) tAGAAGAGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGGTTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccg < 1:1435710‑M2/150‑4 (MQ=255) tAGAAGAGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccg < 1:320896‑M2/150‑4 (MQ=255) agaagaGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgg > 1:1695577‑M2/1‑146 (MQ=255) agaagaGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgg < 1:1594497‑M2/150‑5 (MQ=255) gTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgggttttt > 2:1908895‑M2/1‑140 (MQ=255) ttGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgggtttttt > 1:77250‑M2/1‑139 (MQ=255) gcgTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatta > 1:913080/1‑150 (MQ=255) cgTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTaa > 1:617905/1‑150 (MQ=255) gttagttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAt < 2:576358/150‑1 (MQ=255) ttagttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAtt > 2:1453695/1‑150 (MQ=255) gttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTa > 1:1361007/1‑150 (MQ=255) gttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTa > 2:1340223/1‑150 (MQ=255) taCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTaaa < 1:951909/150‑1 (MQ=255) taCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGGAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTaaa < 1:944847/150‑1 (MQ=255) cTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAAc < 1:556523/150‑1 (MQ=255) tCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACgg > 1:20107/1‑150 (MQ=255) gCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTa > 1:1189686/1‑150 (MQ=255) cTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTaa > 2:1524424/1‑150 (MQ=255) tCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAg < 1:1499696/150‑1 (MQ=255) aacaacTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAggg < 1:378834/150‑1 (MQ=255) aacaacTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAggg < 1:364521/150‑1 (MQ=255) acaacTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTaa < 2:1902559/146‑1 (MQ=255) acaacTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTaa > 1:1902559/1‑146 (MQ=255) cTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTaaaa > 1:1669245/1‑150 (MQ=255) gTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAAtta > 1:1514914/1‑149 (MQ=255) gTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTc > 2:1743715/1‑150 (MQ=255) aCGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAg > 2:1655549/1‑150 (MQ=255) aCGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAg < 2:221746/150‑1 (MQ=255) ccccTTATACGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGAGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCATGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAgg > 2:1925086/3‑150 (MQ=255) gCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACACTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGCTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGa > 2:126012/1‑150 (MQ=255) tATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTc < 2:151299/150‑1 (MQ=255) tATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTc < 1:550708/150‑1 (MQ=255) aTCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCa < 1:797519/150‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGaa > 1:1360750/1‑150 (MQ=255) cAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATAc > 2:1866913/1‑150 (MQ=255) cAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATAc > 2:1085850/1‑150 (MQ=255) aGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCTCAGGTTTTTTTATTAATTCTAAAACGTTAATGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAataataaa < 2:902228/150‑3 (MQ=255) aGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACa > 2:1288368/1‑150 (MQ=255) aaGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATtc > 2:1263147/1‑150 (MQ=255) cGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTctct < 1:1524424/150‑1 (MQ=255) tATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgc < 2:880611/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgct > 1:1580194/1‑150 (MQ=255) ttttGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgctg > 1:552695/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCaa < 2:20107/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAg < 1:1655549/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAg < 2:913080/150‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGa > 1:1811079/1‑150 (MQ=255) ggCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCTAGATg < 2:1189686/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATg < 2:35666/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATg < 2:320896/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATg > 1:1791599/1‑150 (MQ=255) aGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGt < 1:1263147/150‑1 (MQ=255) aTTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATc < 2:1072559/150‑1 (MQ=255) ttAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCt < 2:1580194/150‑1 (MQ=255) gTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCa < 2:385306/150‑1 (MQ=255) tAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCAtt > 1:1938940/1‑150 (MQ=255) aaCCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCAttt > 2:1968265/1‑150 (MQ=255) cccTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgggttttttctttatcaggcaaatagcagggttaaccgctaatctgctccatcgcctgcaaaatacgcttatctgaaatcggataaggcgtaccaagttgtt < 1:1818583‑M2/150‑105 (MQ=255) cccTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTcc < 2:174280/150‑1 (MQ=255) ccTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCt < 1:1453695/150‑1 (MQ=255) cTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCtt < 2:1791599/150‑1 (MQ=255) cTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCtt < 2:1472645/150‑1 (MQ=255) tGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTa > 1:1414947/1‑150 (MQ=255) tGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTa < 2:992603/150‑1 (MQ=255) gCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTaa > 2:355617/1‑150 (MQ=255) tATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgggttttttctttatcaggcaaatagcagggttaaccgctaatctgctccatcgcctgcaaaatacgcttatctgaaatcggataaggcgtaccaagttgttgagcga < 2:373735‑M2/150‑111 (MQ=255) tATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTaaaa < 1:1288368/150‑1 (MQ=255) tATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAACACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTaaaa < 1:531344/150‑1 (MQ=255) aTTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAg < 2:797864/150‑1 (MQ=255) aTTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAg > 2:1465721/1‑150 (MQ=255) aTTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAg < 2:552695/150‑1 (MQ=255) aTTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAg < 1:1968265/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGat > 2:786838/1‑150 (MQ=255) ccTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATg < 2:1594497/150‑1 (MQ=255) ccTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATg < 2:509664/150‑1 (MQ=255) tGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGccgggttttttctttatcaggcaaatggcagggttaaccgctaatctgctccatcgcctgcaaaatacgcttatctgaaatcggataaggcgtaccaagttgttgagcgaagtaacta < 1:1684830‑M2/150‑119 (MQ=255) tAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAgg < 2:1519674/150‑1 (MQ=255) tAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAgg < 2:1360750/150‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGaata > 1:1129819/1‑111 (MQ=255) aaaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGaata < 2:1129819/111‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCATGc < 1:442396/150‑1 (MQ=255) aaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCt > 2:8655/1‑150 (MQ=255) aaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCt > 2:966732/1‑150 (MQ=255) aGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCtt > 1:708123/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGc > 1:212547/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCgg < 1:593289/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGTAAGCATTTAGCGccgggttttctctttatcaggcaaatagcagggttaaccgctaatctgctccatcgcctgcaaaatacgcttatctgaaatcggagaaggcgtaccaagttgttgagcgaagtaactaacgcgcaactct < 1:1768380‑M2/150‑131 (MQ=255) aaCCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAg < 1:1925086/150‑1 (MQ=255) cccGGTAAGCATTTAGCGccgggttttttctttatcaggcaaatagcagggttaaccgctaatatgctccatcgcctgcaaaatacgcttatctgaaatcggataaggcgtaccaagttgttgagcgaagtaactaacgcgcaactcttc < 2:1099825‑M2/150‑133 (MQ=255) cGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGc < 1:1189693/150‑1 (MQ=255) gTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCgg > 2:1687733/1‑150 (MQ=255) cATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAg < 2:1435710/150‑1 (MQ=255) aTTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAgg > 1:496528/1‑150 (MQ=255) tttAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGa < 1:1663561/150‑1 (MQ=255) ttAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGAc < 2:1811079/150‑1 (MQ=255) ttAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGAc < 1:327947/150‑1 (MQ=255) ttAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGAc < 2:212547/150‑1 (MQ=255) gccgggttttttctttatcaggcaaatagcagggttaaccgctaatctgctccatcgcctgcaaaatacgcttatctgaaatcggataaggcgtaccaagttgttgagcgaagtaactaacgcgcaactcttctatcatccaacggatct < 2:32552‑M2/150‑150 (MQ=255) | TGATAGAAGAGTTGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACG > NC_000913/1486860‑1487158 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |