New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2077179 = | 73 (0.650) | 4 (0.040) | 4/258 | NT | 5.5% | coding (68/369 nt) | cbeA | CP4‑44 prophage; cytoskeleton bundling‑enhancing antitoxin CbeA |
? | NC_000913 | 2077221 = | 69 (0.650) | coding (110/369 nt) | cbeA | CP4‑44 prophage; cytoskeleton bundling‑enhancing antitoxin CbeA |
CCGGACCATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAACTGAATCCCC > NC_000913/2077073‑2077364 | tgtttcatcagcagcggaaaggcctggtccaggtggtacgcatctgcatcgctgaacaggcctctgataccggcgcggtcggcaaggtaatgcaaccggttaccccCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggag > 1:269702‑M1/107‑150 (MQ=255) ccGGACCATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggag > 2:970000/1‑150 (MQ=255) ccGGACCATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggag > 2:688364/1‑150 (MQ=255) ggACCATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAggg < 1:1804623/150‑1 (MQ=255) ggACCATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAggg > 1:233721/1‑150 (MQ=255) ccATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTaa > 2:1563868/1‑150 (MQ=255) aTTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAAcc > 1:1232163/1‑150 (MQ=255) aTTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAAcc > 1:870799/1‑150 (MQ=255) ttCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCg > 1:548016/1‑150 (MQ=255) cagcagcggaaaggcctggtccaggtggtacgcatctgcatcgctgaacaggcctctgataccggcgcggtcggcaaggtaatgcaaccggttaccctCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCg > 2:374078‑M1/99‑150 (MQ=255) aGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGc < 2:904164/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCa < 1:1220178/150‑1 (MQ=255) ccGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCAt < 1:1620852/150‑1 (MQ=255) ccGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACCCCCTGTTTCGGGGCACGACTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCAt > 2:1677860/1‑150 (MQ=255) gATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTa < 1:1211887/150‑1 (MQ=255) gATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTa < 1:223440/150‑1 (MQ=255) tCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTg > 1:1789156/1‑150 (MQ=255) gTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCg > 2:1788347/1‑150 (MQ=255) 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tGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCAcc < 1:1067377/150‑1 (MQ=255) tGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGACGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCAcc < 2:1417304/150‑1 (MQ=255) ggggCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGt > 2:260181/1‑150 (MQ=255) gggCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTg < 1:567527/150‑1 (MQ=255) ggCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGa < 2:548016/150‑1 (MQ=255) cACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCTGTGAAc < 1:1095291/150‑1 (MQ=255) cACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAAc < 1:1365187/150‑1 (MQ=255) aCGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAACt < 2:1356524/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAACTg < 1:512952/150‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAACTGa > 2:184881/1‑150 (MQ=255) tgcaggAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAACTGAATcccc > 2:1675518‑M2/7‑150 (MQ=255) | CCGGACCATTCTTAGCCGATTTTCTGTAAGGATTTTATCGTGTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCCGCTGCTGATGAAACAACTGGAACTCATGCTCACCAGCGGTGAACTGAATCCCC > NC_000913/2077073‑2077364 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |