New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 2440374 | NA (NA) | noncoding (31/36 nt) | other | REP170 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
AGGAAATCGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAGCTCTTCA > NC_000913/2440226‑2440523 | aGGAAATCGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGAcc < 1:623392/150‑1 (MQ=255) ggAAATCGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCt < 1:1647738/150‑1 (MQ=255) tCGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGc > 1:1973065/1‑150 (MQ=255) tCGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGc < 2:709306/150‑1 (MQ=255) cGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCg < 1:1857684/150‑1 (MQ=255) gACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGa > 1:1818077/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAAt < 2:202430/150‑1 (MQ=255) cAAAGCGGGAAGTTTGCCCGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAAt < 1:1864109/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAAtt < 1:469870/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTa > 2:62492/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAAta > 2:1406468/1‑149 (MQ=255) cGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATc < 2:635960/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTACCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATc > 1:924213/1‑150 (MQ=255) 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atgatgTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCACGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTg > 1:572126/1‑150 (MQ=255) ctaacgcaaaaGGGAACCTGATGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGCCCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTgcc > 1:1697122/8‑150 (MQ=255) tgtgAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTgccgc > 2:1752/1‑150 (MQ=255) aacgcaaaaGGGAACCTGATGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTTCCAGCGTGGCGTTGGTgccgc > 2:532759/6‑150 (MQ=255) tgAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGccgccg > 1:1514176/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCgccgaa < 2:706256/150‑1 (MQ=255) aaaaGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCgccgaag < 2:1915031/150‑1 (MQ=255) aaaGGGAACCTGATGGTTCCCTTTTTCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCgccgaagc > 2:727245/1‑150 (MQ=255) aaaGGGAACCTGATGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCgccgaagc > 1:1685987/1‑150 (MQ=255) aGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCgccgaagccg > 2:936468/1‑150 (MQ=255) 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tAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACgttacgcgccaatgcggcctccggcactaacgcaaaagggaacctgatggttccctttttcacatcattgacaatcgccgccagttccaggcaaacttcccgctttgtcgattt < 2:1397616‑M2/150‑115 (MQ=255) aCGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATg < 1:1797158/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCa < 1:1847380/150‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACgttacgcgccaatgcggcctccggcactaacgcaaaagggaacctgatggttccctttttcacatcattgacaatcgccgccagttccaggcaaacttcccgctttgtcgatttccttctga < 1:1222277‑M2/150‑123 (MQ=255) aTGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGa > 2:440807/1‑149 (MQ=255) tGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGAcc < 1:466914/150‑1 (MQ=255) gCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACgttacgcgccaatgcggcctccggcactaacgcaaaagggaacctgatggttccctttttcacatcattgacaatcgccgccagttccaggcaaacttcccgctttgtcgatttccttctgaaaa > 2:636397‑M2/1‑25 (MQ=255) cGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCg > 2:412107/1‑150 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGc < 1:62492/150‑1 (MQ=255) cgTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCg < 1:1313245/150‑1 (MQ=255) gTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCg < 2:432429/110‑1 (MQ=255) gTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCg > 1:432429/1‑110 (MQ=255) cTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGAGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAAATGTGGTCAGTTCGCTATCGGTCGTTTCGGTGACTATGTTCAGACCCGCATCGTGGTCTTcc < 2:1973065/150‑1 (MQ=255) tACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCa < 1:173057/150‑1 (MQ=255) tACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCa > 2:1584514/1‑150 (MQ=255) tACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCACAGCCTGCTCGTCCa < 2:1326760/150‑1 (MQ=255) aCTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAg > 1:215559/1‑150 (MQ=255) aCTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAg < 2:215559/150‑1 (MQ=255) cTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAGc < 1:247771/150‑1 (MQ=255) cTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAGc > 1:1258716/1‑150 (MQ=255) cGACgttacgcgccaatgcggcctccggcactaacgcaaaagggaacctgatggttccctttttcacatcattgacaatcgccgccagttccaggcaaacttcccgctttgtcgatttccttctgaaaagacgtacgcgttaaatcctgc > 2:778317‑M2/1‑4 (MQ=255) cGACgttacgcgccaatgcggcctccggcactaacgcaaaagggaacctgatggttccctttttcacatcattgacaatcgccgccagtcccaggcaaacttcccgctttgtcgatttccttctgaaaagacgtacgcgttaaatcctgc > 1:1323271‑M2/1‑4 (MQ=255) cGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAGctct > 1:1408612/1‑150 (MQ=255) aCgttacgcgccaatgcggcctccggcactaacgcaaaagggaacctgatggttccctttttcacatcattgacaatcgccgccagttccaggcaaacttcccgctttgtcgatttccttctgaaaagacgtacgcgttaaatcctgcca > 2:349533‑M2/1‑2 (MQ=255) ccTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAGCTCTTCa > 1:1663374/1‑150 (MQ=255) | AGGAAATCGACAAAGCGGGAAGTTTGCCTGGAACTGGCGGCGATTGTCAATGATGTGAAAAAGGGAACCATCAGGTTCCCTTTTGCGTTAGTGCCGGAGGCCGCATTGGCGCGTAACGTCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTACTCCGACCTACTGCGAATTAATCTTTCAGCTTGCGCATTACCAGCGTGGCGTTGGTGCCGCCGAAGCCGAAGCTGTTAGACATAACGGTGGTCAGTTCGCGATCGGTCGTTTCGGTCACGATGTTCAGACCCGCAGCCTGCTCGTCCAGCTCTTCA > NC_000913/2440226‑2440523 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |