New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2594968 = | 93 (0.820) | 5 (0.050) | 4/262 | NT | 6.2% | coding (892/2016 nt) | tmcA | tRNA(Met) cytidine acetyltransferase |
? | NC_000913 | 2595009 = | 63 (0.580) | coding (851/2016 nt) | tmcA | tRNA(Met) cytidine acetyltransferase |
GTGCCTCGCTGACCATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTAACAACGTTCGAGGAAAACGCGATACCAGTTGATGCAACAATGGCGCAGGTATGGCTGCGGCTTCATCGACCACCAGCCAGTCGGCTTGCTCATCGCTGGCTAACAAGGCATCCGGCGCAATAAAGCGAAACTTCTCGCCCGCAAATT > NC_000913/2594860‑2595156 | gTGCCTCGCTGACCATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTa > 2:1006752/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCGCTGACCATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTa < 1:219310/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCGCTGACCATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTa < 1:1673309/150‑1 (MQ=255) 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gCTGACCATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTAACAACGt > 2:1602016/1‑150 (MQ=255) ccATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTAACAACGTTCGAg < 1:535567/150‑1 (MQ=255) ccATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTAACAACGTTCGAg > 1:1466967/1‑150 (MQ=255) cATTTTTTCCAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTAACAACGTTCGAgg > 1:1583886/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGCATCCCTGCGCCCAGCGGATCGGCTGTTGCAGTTCAAAACGGTGTAAATGCGGAAAGCGAGCGCAAAATTTCAGCAAAAAACCACGTCCGGTGCCTTCGTAGCCCTGCACCGTAGTGGTTAACAACGTTCGAGGAAAACGCGa > 1:1088968/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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