| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2608784 = | 67 (0.590) | 5 (0.050) | 4/268 | NT | 7.0% | coding (298/1668 nt) | hyfG | hydrogenase 4 catalytic subunit HyfG |
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GCTTCCGGTCCTGTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGCCGGATCAGCGTCGCCTGGTGTTGCCCGATGACTGGCCGGAAGATATGCATCCGCTGCGCAAAGATGCGATGGAT > NC_000913/2608663‑2608957 | tatcttccggccagtcatcgggcaacaccaggcgacgctgatccggcaggccaaccggaatcagcccgtacatatcgcgaatttctcgctcgccccagaccgcggcagggacgcgcggtgtGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACAcc > 1:1124289‑M1/122‑150 (MQ=255) atcttccggccagtcatcgggcaacaccaggcgacgctgatccgtcaggccaaccggaatcagcccgtacatatcgcgaatttctcgctcgccccagaccgcggcagggacgcgcggtgtGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACcg > 2:1546414‑M1/121‑150 (MQ=255) ttCCGGTCCTGTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACcgc > 1:113944/1‑150 (MQ=255) cGGTCCTGTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACcgcgcg > 1:1014389/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGTTTGGCAACGATGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGt > 2:811434/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGt > 1:1150548/1‑150 (MQ=255) tGTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTg < 2:807441/150‑1 (MQ=255) tGTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTg > 1:1337456/1‑150 (MQ=255) gTTTGGCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGc > 2:1397153/1‑150 (MQ=255) agtcatcgggcaacaccaggcgacgctgatccggcaggccaaccggaatcagcccgtacatatcgcgaatttctcgctcgccccagaccgcggcagggacgcgcggtgtGACAGTCGGGAGTTTCCGGCAGTCACACCGCGCGTCCCTGc > 1:654112‑M1/110‑150 (MQ=255) gCAACGACGAGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCgg < 1:399812/150‑1 (MQ=255) acgaGCGGACACTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTggg > 2:1520605/1‑150 (MQ=255) acTTAACGGTCATTACGCGGTTTATTATGCCCTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCgaga > 1:226225/1‑150 (MQ=255) 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> 1:1939875/2‑150 (MQ=255) cccTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGGCGACAGTCGGTAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCgg < 1:900588/150‑1 (MQ=255) cccTTTCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCgg > 1:275/1‑150 (MQ=255) ttCAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTgg < 2:646847/150‑1 (MQ=255) cAATGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGcc < 1:1520605/150‑1 (MQ=255) tGGAAGGGGCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGc > 1:166417/1‑150 (MQ=255) ggCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGCCGGATCa > 1:1495963/1‑150 (MQ=255) gCCGAAAAATGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGCCGGATCAg > 1:1117517/1‑150 (MQ=255) aaaaTGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGCCGGATCAGCGTCg > 1:380781/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCTGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGCCGGATCAGCGTCGcc < 1:1428336/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGGATTGTGGTGAAGGCGCTGGTCGATGCCGACAGTCGGGAGTTTCCGTCAGTCACACCGCGCGTCCCTGCCGCGGTCTGGGGCGAGCGAGAAATTCGCGATATGTACGGGCTGATTCCGGTTGGCCTGCCGGATCAGCGTCGcc < 1:1397153/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |