| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2882885 = | 100 (0.880) | 6 (0.060) | 6/262 | NT | 6.1% | coding (1254/1509 nt) | casA | type I‑E CRISPR system Cascade subunit CasA |
| ? | NC_000913 | 2882904 = | 90 (0.830) | coding (1235/1509 nt) | casA | type I‑E CRISPR system Cascade subunit CasA | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ATAGCATTTCACACAATTGATGAAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATCAACACATC > NC_000913/2882755‑2883052 | aTAGCATTTCACACAATTGATGAAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTc > 1:952173/1‑150 (MQ=255) tgggtggcaacaatacggcaatgtgttaaacgaaatagtgactgttggtttgggatataaaacagccttacgcaaggcgttatatacctttgcagaagggtttaaaaataaagacttcaaaggggccggAGTCTCATGAACAGAGACTcc > 2:59453‑M1/130‑150 (MQ=255) ggtggcaacaatacggcaatgtgataaacgaaatagtgactgttggtttgggatataaaacagccttacgcaaggcgttatatacctttgcagaagggtttaaaaataaagacttcaaaggggccggAGTCTCATGAACAGAGACTCCgg > 1:131903‑M1/128‑150 (MQ=255) 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acaATTGATGAAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGa < 2:1974186/150‑1 (MQ=255) caATTGATGAAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGaa > 1:365848/1‑150 (MQ=255) atacggcaatgtgataaacgaaatagtgactgttggtttgggatataaaacagccttacgcaaggcgttatatacctttgcagaagggtttaaaaataaagacttcaaaggggccggAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGaa < 2:1597569‑M1/33‑1 (MQ=255) gatgaAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCtt > 1:1106403/1‑150 (MQ=255) tgaAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTa > 1:851645/1‑150 (MQ=255) 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CTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGAtt > 1:489636‑M1/1‑150 (MQ=255) TCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTa < 1:1571497‑M1/150‑1 (MQ=255) CATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTaa < 2:507904‑M1/150‑1 (MQ=255) tGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAAc < 1:1738645/150‑1 (MQ=255) tGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAAc < 1:258269/150‑1 (MQ=255) tGAACAGAAACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAAc < 1:1557340/150‑1 (MQ=255) gAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACa < 1:132000/150‑1 (MQ=255) aCAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCACATGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTATATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATc < 2:1631554/150‑1 (MQ=255) aCAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATc < 2:898610/150‑1 (MQ=255) gagactCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATCAac > 2:1469487‑M2/7‑150 (MQ=255) gactCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATCAacac < 1:477900‑M2/146‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATCAACACATc < 2:1489785‑M2/149‑1 (MQ=255) | ATAGCATTTCACACAATTGATGAAGTTTGTCTCGTAAATCAGCTATTACCTCATCAGCCTGGGAAAAATTAACATTCGCCAGTACATCGGGAATTAATAATTCACTCTGTCGATAGAAATGCCTTTCTGCAGTCTCATGAACAGAGACTCCGGCCCCTTTGAAGTCTTTATTTTTAAACCCTTCTGCAAAGGTATATAACGCCTTGCGTAAGGCTGTTTTATATCCCAAACCAACAGTCACTATTTCGTTTATCACATTGCCGTATTGTTGCCACCCCTGATTAAACATCAACACATC > NC_000913/2882755‑2883052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |