New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2930257 = | 79 (0.700) | 6 (0.060) | 5/264 | NT | 7.3% | coding (682/1368 nt) | sdaB | L‑serine deaminase II |
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CGAGCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATCCCGG > NC_000913/2930160‑2930458 | cGAGCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCg < 2:497372/150‑1 (MQ=255) cagcgttctcttcgttcactgccagtgcaaacatgttgatccagtcaacaaccgccatcgggtcggtggtggttttatcctggctgaccagcatccGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCgg > 2:707378‑M1/97‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATg > 1:219060/1‑150 (MQ=255) 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gTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATc < 2:1008699/150‑1 (MQ=255) cATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCaa > 2:163268/1‑150 (MQ=255) cATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCaa > 1:1137950/1‑150 (MQ=255) cATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCaa > 1:815223/1‑150 (MQ=255) cgcgGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATg < 2:1331840/150‑1 (MQ=255) 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ccagcatccggcgtagtgccgcagcacggcgtggaacgcgcagtttgccaggcaacacgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAagag > 1:734746‑M2/62‑150 (MQ=255) aCCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAAc > 2:1839905/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACgc > 2:1640437/1‑150 (MQ=255) ccggcgtagtgccgcagcacggcgtggaacgcgcagtttgccaggcaacacgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACCGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACgctg > 2:707378‑M2/55‑150 (MQ=255) ggcgtagtgccgcagcacggcgtggaacgcgcagtttgccaggcaacacgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACgctgct > 2:1453060‑M2/53‑150 (MQ=255) 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aCGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCgtggtg < 2:670800/136‑1 (MQ=255) aCGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTaa > 2:475684/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACg > 2:1987746/1‑104 (MQ=255) ccGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACg < 1:1987746/104‑1 (MQ=255) cGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGgt < 1:846968/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGgtgc > 2:452718/1‑150 (MQ=255) cGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGtgcgtgcg < 1:126042/150‑1 (MQ=255) gCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCggg > 2:1591938/1‑150 (MQ=255) gCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCggg > 2:932345/1‑150 (MQ=255) gCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCggg > 1:622713/1‑150 (MQ=255) acgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTAt < 1:37707‑M2/145‑1 (MQ=255) acgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTAt > 1:1842862‑M2/6‑150 (MQ=255) cgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATc < 2:72280‑M2/146‑1 (MQ=255) ggATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATCCCgg < 2:176325/150‑1 (MQ=255) | CGAGCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATCCCGG > NC_000913/2930160‑2930458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |