| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3628750 = | 86 (0.760) | 4 (0.040) | 3/262 | NT | 5.1% | coding (789/2736 nt) | rbbA | ribosome‑associated ATPase |
| ? | NC_000913 | 3628785 = | 66 (0.610) | coding (754/2736 nt) | rbbA | ribosome‑associated ATPase | |||||
GCGTGGAATGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTGCCAGTTGCCAGCACTTCTCCGGCATTCATCGCTACCAGCCAGTCGAAGCGTTCGGCCTCTTCCATATAGGCGGTGGCGAC > NC_000913/3628636‑3628929 | gcgTGGAATGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTaa > 1:933866/1‑150 (MQ=255) cgTGGAATGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAAc < 1:1117279/150‑1 (MQ=255) ttcgactggctggtagcgatgaatgccggagaagtgctggcaactggcagcgccgaagatctacggaagcaaacggaaagcgctatgctggaagaagcatttataaatatgtTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACa > 2:316335‑M1/113‑150 (MQ=255) ttcgactggctggtagcgatgaatgccggagaagtgctggcaactggcagcgccgaagagctacggcagcaaacgcaaagcgctacgctggaagaagcatttataaatctgtTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACa > 2:316329‑M1/113‑150 (MQ=255) gTGGAATGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACa < 1:1012251/150‑1 (MQ=255) tcgactggctggtagcgatgaatgccggagaagtgctggcaactggcagcgccgaagagctacggcagcaaacgcaaagcgctacgctggaagaagcatttataaatctgtTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAg > 2:922575‑M1/112‑150 (MQ=255) gAATGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGAt > 2:1613697/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGAtt < 2:172757/150‑1 (MQ=255) aTGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGAttt < 1:1584458/150‑1 (MQ=255) tggctggtagcgatgaatgccggagaagtgctggcaactggcagcgccgaagagctacggcagcaaacgcaaagcgctacgctggaagaagcatttataaatctgtTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTta > 2:1331083‑M1/107‑150 (MQ=255) tGCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTta > 2:1444973/1‑150 (MQ=255) gCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTtat > 1:1586388/1‑150 (MQ=255) gCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTtat < 1:745278/150‑1 (MQ=255) gCGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTtat < 1:1909513/150‑1 (MQ=255) cGGAAATTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTtata > 1:288597/1‑150 (MQ=255) aTTAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGc > 1:423969/1‑150 (MQ=255) ttAACGTGATCAACGGCAACGAAGGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGct < 2:1941293/150‑1 (MQ=255) cGTGATCAACGGCAACGAACGAACCAAAACGCATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGcttctt > 2:1746353/1‑150 (MQ=255) 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cATGGTCAGATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAg > 2:1819843/1‑150 (MQ=255) gATCGCGCGCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCgg > 2:1775162/1‑150 (MQ=255) cgcgcgCTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGgcgc > 1:324138/1‑150 (MQ=255) gcgctcTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCATCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCt < 1:297036/150‑1 (MQ=255) cgcgcTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCTCTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTg < 1:1182002/150‑1 (MQ=255) cgcgcTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTg < 2:1586388/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTGc < 2:1569722/150‑1 (MQ=255) cgcTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTGcc < 2:1223106/150‑1 (MQ=255) cgcTTCGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTGcc < 2:136137/150‑1 (MQ=255) cGATGGCAATCTCTGCGTTTTCAGGTTGATACGGTGGGATCACTACCGCCTGATGCGCCTGGCGTTGCGCTTGCGGTAACAGATTTATAAATGCTTCTTCCAGCGTAGCGCTTTGCGTTTGCTGCCGTAGCTCTTCGGCGCTGCCAGTTg > 1:982405/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |