| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4328345 = | 216 (1.910) | 12 (0.110) | 10/260 | NT | 5.7% | coding (1211/2229 nt) | crfC | clamp‑binding sister replication fork colocalization protein |
| ? | NC_000913 | 4328378 = | 193 (1.800) | coding (1244/2229 nt) | crfC | clamp‑binding sister replication fork colocalization protein | |||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TTTTGCCCATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGCAGCTA > NC_000913/4328229‑4328526 | ttttGCCCATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTc > 2:1425067/1‑150 (MQ=255)ttttGCCCATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTc < 1:1675948/150‑1 (MQ=255)ttgccgcaattgttcacaagcgacgtttaacccgtgcgcacgaaaatccaggtattcccgcgcctgctgcgcgtaattcaacagtttatgcgcggcagatcgcagagcatacaacgAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTc > 1:1659523‑M1/117‑150 (MQ=255) ttGCCCATACCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGt > 2:1477011/1‑150 (MQ=255) gCCCATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTg < 1:1777037/150‑1 (MQ=255) gCCCATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTg < 2:894153/150‑1 (MQ=255) cgcaattgttcacaagcgacgtttaacccgtgcgcacgaaaatccaggtattcccgcgcctgctgcgcgtaattcaacagtttatgcgcggcagatcgcagagcatacaacgAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTg > 2:957589‑M1/113‑150 (MQ=255) gcaattgttcacaagcgacgtttaacccgtgcgcacgaaaatccaggtattcccgcgcctgctgcgcgtaattcaacagtttatgcgcggcagatcgcagagcatacaacgAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGt > 2:1345972‑M1/112‑150 (MQ=255) cccATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGt > 2:1703160/1‑150 (MQ=255) cccATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGt < 2:1179623/150‑1 (MQ=255) ccATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTa < 2:1803575/150‑1 (MQ=255) cATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTAt > 1:510474/1‑150 (MQ=255) attgttcacaagcgacgtttaacccgtgcgcacgaaaatccaggtattcccgcgcctgctgcgcgtaattcaacagtttatgcgcggcagatcgcagagcatacaacgAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATg > 1:1557696‑M1/109‑150 (MQ=255) tGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGc < 1:906576/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCTTGCCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGct > 2:87497/1‑150 (MQ=255) gcTTGGCAGGCGCTGGCGGCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 2:1990596/150‑1 (MQ=255) ttGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGAt < 1:1222248/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATc < 1:479067/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTg > 1:1069772/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGcc < 1:379623/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCAt > 1:212682/1‑150 (MQ=255) tCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACt > 1:579976/1‑150 (MQ=255) cATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTa > 2:515502/1‑122 (MQ=255) 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ggCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgc < 2:1899344/150‑1 (MQ=255) ggCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTCCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgc > 2:471461/1‑150 (MQ=255) aCCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCgcagc < 1:1426310/150‑1 (MQ=255) ccTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTa > 1:1186177/1‑141 (MQ=255) ccTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCgcagca > 1:1147978/1‑150 (MQ=255) ccTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCgcagca > 1:79865/1‑150 (MQ=255) tCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAgg > 1:1517787/1‑150 (MQ=255) tCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAgg > 2:743591/1‑150 (MQ=255) cGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgc > 1:293446/1‑150 (MQ=255) cGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgc > 1:851557/1‑150 (MQ=255) 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TGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCTCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAAGAATTGCGGCAAAATATcc > 2:1400666‑M1/1‑150 (MQ=255) gCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATcca > 1:730994/1‑150 (MQ=255) cTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATccac > 2:1129668/1‑150 (MQ=255) ttCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATccacc < 1:749190/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATccacc < 2:1253262/146‑1 (MQ=255) tGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGAt > 2:67531/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATc > 1:149193/1‑150 (MQ=255) cGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCga < 2:119019/150‑1 (MQ=255) gCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCgaa < 2:1517787/150‑1 (MQ=255) gCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGGCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCgaa < 1:1404246/150‑1 (MQ=255) cTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCgaag < 1:1728413/150‑1 (MQ=255) cTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCgaag < 2:386909/150‑1 (MQ=255) aCGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGaaa > 2:559324/1‑150 (MQ=255) tAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGttt < 2:269891/150‑1 (MQ=255) aacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTg > 1:1017845‑M2/8‑150 (MQ=255) acgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGc < 1:1583059‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGCa < 2:1572974‑M2/145‑1 (MQ=255) cctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGCAGc > 1:535385‑M2/4‑150 (MQ=255) cctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGCAGc > 2:332850‑M2/4‑150 (MQ=255) tCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTaaa > 1:824504‑M2/2‑92 (MQ=255) tCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGCAGCTa > 2:1857454‑M2/2‑150 (MQ=255) | TTTTGCCCATGCCGCGCTTGGCAGGCGCTGGCGTCATGCCGATCTGGCGGACCTCGAACATATTCGTCATGCTGCCGATCAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGGATTTTCGTGCGCACGGGTTAAACGTCGCTTGTGAACAATTGCGGCAAAATATCCACCAGATCGAAGAAAGTTTGCAGCTA > NC_000913/4328229‑4328526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |