New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4344813 = | NA (NA) | 15 (0.140) | 11/256 | NT | NA | intergenic (+23/+116) | melB/yjdF | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter/conserved inner membrane protein YjdF |
? | NC_000913 | 4344842 = | NA (NA) | noncoding (27/29 nt) | other | REPv327a |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAATATCA > NC_000913/4344693‑4344990 | tccagatccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTc > 1:1779325/1‑150 (MQ=255) cagatccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 1:152460/1‑150 (MQ=255) gctccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaa > 2:468305/3‑150 (MQ=255) gatccaTCTGCTGGATTAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaa < 1:781819/150‑1 (MQ=255) caTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgta < 1:1029086/150‑1 (MQ=255) tCTGCTGTATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGAGGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaat < 1:1681315/150‑1 (MQ=255) gctgGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGACCACGTCTtaatg < 1:1092895/143‑1 (MQ=255) ggATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 2:514409/150‑1 (MQ=255) gATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTgg > 2:1746100/1‑150 (MQ=255) aTAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGa < 1:564822/150‑1 (MQ=255) aaaTATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAtt < 2:892204/150‑1 (MQ=255) ccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg > 2:1649267‑M1/96‑150 (MQ=255) atatCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGTTTTg < 2:1822144/150‑1 (MQ=255) 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GATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCaa < 2:1494564‑M1/150‑1 (MQ=255) ataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAAt < 2:140539‑M2/128‑1 (MQ=255) TGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATg > 1:443491‑M1/1‑150 (MQ=255) cGATATGTTTATCAGGCCACTGCTTAATGTAATCCTTTGGATTTCCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCCCGCCGCATCCGCCATCACCAACGCGCAAGTTGTTAGCCGGTTAACAAGCCAACGCGCCTTAGATGCCGGAATTGaa > 2:943131/1‑150 (MQ=255) cGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGaa > 1:364067/1‑150 (MQ=255) cGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGaa < 2:1469735/150‑1 (MQ=255) gATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGaaa > 2:971056/1‑150 (MQ=255) tatGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagc > 1:304183/1‑150 (MQ=255) tGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagcga > 1:1962133/1‑150 (MQ=255) gTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagcgag < 2:187736/150‑1 (MQ=255) 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GGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAATATCA > NC_000913/4344693‑4344990 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |