| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 313,278 | T→G | 7.2% | intergenic (‑36/+438) | ykgR ← / ← ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 313,278 | 0 | T | G | 7.2% | 522.6 / 23.2 | 164 | intergenic (‑36/+438) | ykgR/ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/101); new base G (3/9); total (54/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TTATTTCCGTTATTAATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGATATATGTCGCCTGAAGTCAGTTCCGGGAATGAGTCTGATC > NC_000913/313129‑313427 | ttATTTCCGTTATTAATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGt < 1:659991/150‑1 (MQ=255) tttCCGTTATTAATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAg < 2:1382915/150‑1 (MQ=255) tttCCGTTATTAATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAg < 1:114072/150‑1 (MQ=255) 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TTATTTCCGTTATTAATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGATATATGTCGCCTGAAGTCAGTTCCGGGAATGAGTCTGATC > NC_000913/313129‑313427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |