| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 313,285 | C→A | 6.6% | intergenic (‑43/+431) | ykgR ← / ← ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 313,285 | 0 | C | A | 6.6% | 549.0 / 20.1 | 166 | intergenic (‑43/+431) | ykgR/ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/103); new base A (2/9); total (53/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TTATTAATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGATATATGTCGCCTGAAGTCAGTTCCGGGAATGAGTCTGATCTCAAGAC > NC_000913/313138‑313434 | tattaATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAAAAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTTTACTTTATTCTCTTTCATTTGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCAATTATTAAGTGACCtt < 2:1819493/150‑1 (MQ=255) attaATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTta < 2:1754976/150‑1 (MQ=255) ttaATAGAAATGGAGAAATAAATAGGCGTATTCTACAATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTtat < 2:916660/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |