| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,948,543 | C→T | 6.1% | A156A (GCG→GCA) | amiC ← | N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,948,543 | 0 | C | T | 6.1% | 200.3 / 2.4 | 65 | A156A (GCG→GCA) | amiC | N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/32); new base T (2/2); total (31/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
TCCCCACCGCACCGGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCTTTAATTCAAAAACCATCCGTACGGTTTGCG > NC_000913/2948395‑2948688 | tCCCCACCGCACCGGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTccagcagcg < 1:1523988/150‑1 (MQ=255) cccACCGCACCGGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTccagcagcgcc < 1:1459818/150‑1 (MQ=255) caccgcaccgGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTccagcagcgccag > 2:356969/1‑150 (MQ=255) ccgcaccgGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTTATCCTacaggtgcgccagca < 2:1863070/150‑1 (MQ=255) cgGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGt < 2:1918398/150‑1 (MQ=255) gTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTg > 2:1637077/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCa < 2:1117472/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCa > 2:847568/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCa > 1:242999/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCa > 2:324632/1‑150 (MQ=255) ttCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCat < 1:1046830/150‑1 (MQ=255) ttCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCat < 2:635208/150‑1 (MQ=255) ccACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATcc < 1:1600363/150‑1 (MQ=255) aCCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCtg < 1:966091/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGCGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCtgt > 1:785314/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCa < 2:1351449/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCAtt > 1:884925/1‑150 (MQ=255) ccAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTg > 1:1835963/1‑150 (MQ=255) ccAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACACGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTg > 1:1582661/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTgg > 2:1459015/1‑150 (MQ=255) gggTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGcc > 1:452840/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGAATAATGACAATCGGACGATCTCGCCCTTATTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCg > 2:1917882/1‑150 (MQ=255) gTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCgg < 2:591515/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCgg > 1:210489/1‑150 (MQ=255) tCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGa < 2:724270/150‑1 (MQ=255) gCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGGTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGGCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATaga < 2:1039295/150‑1 (MQ=255) aTAATGACAATCGGCCGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTCTGCATTGGCCGGATAGAgg > 1:1296138/1‑150 (MQ=255) aaTGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTc < 1:1868582/150‑1 (MQ=255) aTGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTcc < 2:710733/150‑1 (MQ=255) tGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCa < 1:816169/150‑1 (MQ=255) cAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCa > 2:856850/1‑150 (MQ=255) cAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCa > 1:858095/1‑150 (MQ=255) ggACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGa < 2:452840/150‑1 (MQ=255) gACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGAc > 2:1230015/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCCTGCTTTACGCGGTTGTTGACCACTTTGCGGTGGCGGCACCTGCTTTTCTAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGctc < 2:210489/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGctc > 2:1743388/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAAc < 1:847568/150‑1 (MQ=255) tGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAAccc < 1:1057025/150‑1 (MQ=255) tGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAAccc < 1:880267/150‑1 (MQ=255) cTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGTATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCgg < 1:565140/150‑1 (MQ=255) ttACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGTGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATcc > 2:1990180/1‑99 (MQ=255) ttACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGTGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATcc > 2:1983278/1‑99 (MQ=255) ttACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGTGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATcc < 1:1983278/99‑1 (MQ=255) ttACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGTGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATcc < 1:1990180/99‑1 (MQ=255) cccGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGAcc > 1:1569797/1‑150 (MQ=255) cccGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGAcc > 1:1364036/1‑150 (MQ=255) gTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGgcg < 1:1459015/150‑1 (MQ=255) ggACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAgg > 1:417482/1‑150 (MQ=255) ggACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAgg < 2:1364036/150‑1 (MQ=255) ccACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGTATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCa > 2:106595/1‑150 (MQ=255) ccACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCa > 1:866712/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCgg < 1:356969/150‑1 (MQ=255) ggcggcACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGt > 1:13190/1‑150 (MQ=255) ggcggcACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGt < 1:1348937/150‑1 (MQ=255) gggcACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGttt < 2:1835963/149‑1 (MQ=255) cggcACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGttt < 1:1637077/150‑1 (MQ=255) cTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGtt > 1:336018/1‑150 (MQ=255) cTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGtt > 2:1653673/1‑150 (MQ=255) tttCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCt > 2:614948/1‑150 (MQ=255) ttCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCtt < 1:324632/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCttt > 1:1902369/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCttt > 2:814130/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCttt < 1:1743388/150‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCTTTaa < 2:242999/150‑1 (MQ=255) 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agcagcgccagcagcgGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCTTTAATTCAAAAACCATCCGTACGGTTTGc > 2:378522/1‑150 (MQ=255) gcagcgccagcagcgGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCTTTAATTCAAAAACCATCCGTACGGTTTGCg > 1:901846/1‑150 (MQ=255) | TCCCCACCGCACCGGAGTCTTCGCCACCGTGGCCAGGGTCAAGCATAATGACAATCGGACGATCGCGCCCTGCTTTACCCGGTTGTGGACCACTTTGCGCTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCCTGCATATCCTGTGCATTGGCCGGATAGAGGTCCATCACCAGACGCTCTTTAAACCCGGCGACCGGCGCAAGGGCAAACAGCTGCGGTTTTACGTTTTGCTTTAATTCAAAAACCATCCGTACGGTTTGCG > NC_000913/2948395‑2948688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |